运用SLAF-seq技术构建水稻高密度遗传图谱

对精细定位某一特定性状位点来说，高密度遗传图谱是一个非常实用的工具。本研究以水稻品种V20B/CPSLO17组合衍生的150份重组自交家系作为作图群体，利用特定位点扩增长度测序(SLAF-seq)技术，一种基于下一代测序技术进行大规模开发SNP和基因型分析的高通量新策略，开发SLAF标签和构建水稻高密度遗传图谱。我们共检测到67017个高质量的SLAF标签，其中多态性SLAF有15853个，符合构建高质量遗传图谱使用要求的多态性SLAF标签有8657个。最终成功构建了一个包含12个连锁群，8602个上图标记，总图距为2508.65 cM，标记间平均距离为0.29 cM的高密度遗传图谱，该图谱可用于重要农艺性状QTL定位。