中英开展代谢组学数据共享合作

由欧洲生物信息研究所、英国基因组分析中心、华大基因及GigaScience共建的代谢组学数据共享中英联盟获得BBSRC资助

2015年5月11日，由欧洲生物信息研究所、英国伯明翰大学、曼彻斯特大学、牛津大学、塞恩斯伯里实验室、英国基因组分析中心、华大基因及其开放式大数据期刊《GigaScience》组成的合作联盟获得了英国生物技术和生物科学研究理事会（BBSRC）的基金资助，助推代谢组学的数据共享和分析。

代谢组学即采用质谱仪对生物体内的小分子（代谢物）进行检测和量化，再通过计算程序分析，以确定代谢物的丰富性。这些结果将用于评估个体的细胞情况和健康状态。成立于2012年的MetaboLights平台可以储存和共享这些数据。然而，目前数据共享的步伐还无法跟上代谢组学科学论文的出版速度。

合作联盟将使用BBSRC资助的3万英镑举办培训班，支持中英科学家管理和共享他们的代谢组学数据和分析。BBSRC强调，这些计算能力对于进一步加深科学对社会和经济的影响必不可少。该合作联盟将与Software Carpentry、Data Carpentry、ELIXIR和Galaxy Project这四大致力于计算和生物信息技术能力建设的国际网络携手合作。

《GigaScience》杂志数据管理经理Peter Li表示，BBSRC的基金支持将实现我们数据管理和出版经验与英国合作伙伴代谢组学专业知识之间的协作与交流。”他还补充道，“GigaScience一直致力于以公开的方式推动科学传播，生物信息学教育也是华大基因非常感兴趣的领域。”

欧洲生物信息研究所Christoph Steinbeck补充道：“代谢组学学术界已经在数据共享和再利用方面进行很多的投入。我们的主要挑战在于培训大家如何最好地将这个融入到日常的工作中。BBSRC已经认识到分子生物学的发展比其他领域更为迅速，并且我们需要尽我们的所能培训和推动科学家进行数据共享。这将带来更高质量的数据、更有效率的研究和耗时更短的科学发现。”

英国基因组分析中心Vicky Schneider表示，通过与GigaScience和华大基因合作，我们的目标是重振英国乃至全球的代谢组学数据共享。英国基因组分析中心将在对科学家进行代谢组学数据管理和共享的信息学培训方面发挥重要作用，从而提高代谢组学在全球学术界的价值。

该联盟获得BBSRC中国合作研究资助奖计划（China Partnering Award）的支持。