中美科研人员成功构建大鼠转录组图谱

中美科研人员利用高通量序列测定来测序和定量RNA进行转录组分析的方法,对来自幼年、青春期、成年及老年的雌雄且具有正常免疫功能的Fischer 344大鼠、涵盖11种器官和4个发育阶段的大鼠320个样本进行了RNA测序,由此构建出了一张综合大鼠转录组图谱,绘制出40064个基因和65167种转录物表达谱。

由复旦大学药学院石乐明教授和美国洛马林达大学Charles Wang博士作为共同通讯作者的反映该研究成果的论文,于2月10日发表在《自然·通讯》杂志上。

专家认为,该大鼠转录组图谱可与其他数据库交联,通过网络获取,为利用大鼠模型开展生物医学研究提供了一个重要的资源。

大鼠可用来开展药物和化学毒性测试,评估潜在药物效应机制,以及模拟人类疾病。利用RNA测序编写出从出生到老年整个大鼠生命期以及两性之间的转录组差异变化表,能够提供关于疾病易感性、药物疗效与安全性、毒性机制的一些新认识,最终促使一些临床前研究成果转化应用于人类疾病防治。

科研人员还发现了一些器官富集、差异性表达的基因,反映出已知的器官特异性生物活性。大量的转录物还显示出器官特异性、年龄依赖性或性别特异性的差异表达模式。

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