南药胆木的基因组调查及SSR分子标记分析

胆木(Nauclea officinalis Pierre. ex Pitard)是中国著名南药，它有着悠久的用药历史。本研究采用 Illumina Hi-Seq 高通量测序技术，基于 K-mer 分析手段来研究胆木基因组的大小及杂合度，利用 MISA 方法分析可能的 SSR 分子标记。结果表明，胆木的基因组大小为 788.38 Mb，杂合度为 0.28%，重复序列比例为50.56%。在基因组序列中，进行 SSR 分子标记分析，共鉴定出了 237 398 个 SSR，其中，单、双核苷酸重复模体的比例较高。通过对传统南药胆木的基因组大小、杂合度调查及 SSR 分子标记分析，为胆木的道地性形成和资源保护及品种选育提供了遗传信息。