水稻抗褐飞虱基因 Bph3 特异性分子标记开发及应用

Bph3 是一个对褐飞虱具有广谱、持久抗性的主效基因，对水稻抗褐飞虱育种具有重要利用价值，但其至今仍缺乏基因特异性标记，限制了分子辅助育种中对它的高效利用。本研究通过对 Bph3 不同等位基因编码区进行测序比对，获得两个 Bph3 特异性 SNP 位点 SNP1 (Bph3 为 T, 其余为 C)和 SNP2 (Bph3 为 C, 其余为T)。在等位基因特异性 PCR (allele-specific polymerase chain reaction, AS-PCR)方法的基础上，开发两对显性标记特异扩增两个 SNP 位点来分别鉴定 Bph3 和其余等位基因型，组合使用两对显性标记即可获得一套鉴定Bph3 基因型的共显性标记。使用该套标记对水稻品种基因组 DNA 进行 PCR 扩增，鉴定 PCR 产物条带大小即可区分 Bph3 不同基因型。利用该方法对 Bph3 基因进行分子标记辅助选择育种，可快速有效的将其导入目标水稻品种，加快水稻抗褐飞虱品种选育进程。