Nat Commun:科学家如何利用DNA样本来构建人群的迁移图谱?

最近,一项刊登于国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自美国家谱网站Ancestry.com上的研究人员利用收集自用户样本及家谱信息的相关数据开发出了一种后殖民地时期北美人口的迁徙模式地图,这项研究中,研究人员描述了他们如何从数据库中收集信息并对信息进行分析,以及如何绘制出人类迁移过程的图谱。

研究人员表示,对后殖民时期北美人口的遗传研究就能够为我们提供关于早期人类迁移以及定居模式的准确图片信息。Ancestry.com网站能够让用户们利用DNA工具包来收集并且提交其DNA样本信息,用户们可以得到关于家族史的大致信息,而且Ancestry网站也能够获取数据用来建立信息。

截至目前为止,Ancestry网站已经拥有超过300万人的用户数据,本文研究中,研究人员利用大约7000人的基因型数据以及其家谱档案信息,创建出了北美洲的人群迁移和文化图谱,同时他们还利用多种工具创建出了19世纪初期至20世纪初期之间的60个基因相关的社区;为了填充附加的信息并且提供合理的解释来说明为何研究人员能够设计出这种迁移模式,研究人员同哈佛大学的历史学家进行了合作,当将各种信息组合在一起进行分析后,研究人员就创建出了人口迁移和文化集群结合在一起的新型“地图”。

利用数据库中的历史信息,研究人员通过对某些群体过去更久远的事件进行分析,鉴别出了哪些人群是从欧洲的区域中迁移过来的,比如,研究者就发现,一代又一代的法国移居者都来自加拿大人口比较密集的地区,其中有些人后来迁移到了新英格兰的某些地区。

值得注意的是,Ancestry网站创建的图谱似乎还能够提供更多的信息,同时其还能够为研究者们提供相关的研究线索来帮助阐明携带不同基因型的人群对多种疾病的易感性;最让研究者感兴趣的一点就是随着更多用户填写他们的数据,网站的数据库将会不断扩张,未来有一天网站或许就能够为科学家们提供前所未有的历史信息来供研究。



参考文献:

Eunjung Han, Peter Carbonetto, , Kenneth G. Chahine & Catherine A. Ball. Clustering of 770,000 genomes reveals post-colonial population structure of North America. Nature Communications. 07 February 2017 doi:10.1038/ncomms14238

本文来源于:生物谷

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