黄果柑XET基因的克隆及其序列分析

以成熟的黄果柑果实为材料，根据已登录植物的XET基因并参考甜橙基因组设计特异性引物，采用同源克隆方法，获得黄果柑XET基因完整的编码区序列，命名为CitXET。运用生物学软件对该序列及其编码的氨基酸序列进行相关生物信息学及结构功能分析，结果显示黄果柑XET基因长960 bp，与其它植物序列具有较高的同源性。该基因编码319个氨基酸，蛋白质分子量为37.4547 kD，等电点为9.05，分子式为C1724H2548N448O466S14，是一个具有跨膜结构的亲水性蛋白。序列比对及进化树分析，XET在进化的过程中具有高度的保守性。同时，CitXET蛋白二级结构有21%的α-螺旋，30.72%的延伸链，9.09%的β-转角，39.18%的无规蜷曲。黄果柑XET具有GH16等结构域，属于糖苷水解酶GH16超家族的成员，其含有该家族的特征基序DEIDFEFLG，β-卷芯(β-jellyroll)折叠，同时预测该蛋白质可能参与碳水化合物代谢，木葡聚糖代谢，细胞壁生物合成等过程。本研究分离鉴定了黄果柑XET基因，同时初步了解该基因的生物学信息，有助于进一步探讨其的表达模式和具体功能，为黄果柑果实品质的改善提供理论依据。