Illumina:缔造基因测序界的“苹果”
仪器信息网,2012-07-05
导读:从生物芯片产品到高通量测序领域,Illumina公司不断推出新产品,占有着世界高通量测序市场70%左右的份额。这与苹果公司通过不断创新来推动智能手机的革命,并取得了全球高端手机市场大部分的份额有着惊人的相似。
Illumina是由David Walt博士、CW 集团的Larry Bock、兽医学博士John Stuelpnagel、 Anthony Czarnik博士及Mark Chee博士于1998年4月共同组建的,总部设于加利福尼亚的圣地亚哥,2000年7月公开上市。Illumina致力于基因序列分析的研究和应用,主推高通量芯片和高通量测序技术,参与了人类基因组计划、全基因组连锁关联项目等大型科研项目,帮助推进了产前筛查、癌症诊断等多个应用领域的发展,在基因测序领域有着举足轻重的地位。
截止到2012年,Illumina公司进入中国已有7个年头,从生物芯片产品为主到进入高通量测序领域,再到现在占据了高通量测序的主导地位,Illumina在中国一直保持着每年双位数的增长,并占有着世界高通量测序市场70%左右的份额。在技术研发方面,Illumina公司2011年推出的MiSeq系统推动了基因测序从大型实验室向中小型实验室发展的步伐,2012年即将推出的HiSeq2500更是使“一天一个基因组”的愿望成为现实。而这些与苹果公司通过不断创新来推动智能手机的革命,并取得了全球高端手机市场大部分的份额有着惊人的相似。那么,Illumina公司为何能获得广大客户的普遍认可?它的产品又有哪些特点?Illumina中国市场部经理刘雪燕女士和销售部经理江滔先生给出了详细解答。
高通量与中低通量兼顾,全面满足不同客户的不同需求
Illumina公司市场部经理刘雪燕女士介绍了公司的产品线,从GA到HiSeq到MiSeq,产品系列可满足整个测序市场的需求。
高通量测序方面,Illumina有HiSeq2000和最新推出的HiSeq2500,HiSeq2000一次运行可产生600Gb的数据,在单次运行中实现了大量基因组、外显子组、或转录组的测序,让大型研究能在最少的运行中完成。另外,HiSeq2500在拥有HiSeq2000高产量模式的基础上又增加了快速运行模式,可在一天以30倍覆盖度完成基因组测序或其他的快速多重应用,如外显子组重测序等,使“一天一个基因组”成为现实。而且客户可在高产量模式和快速运行模式间无缝转换,以满足不同研究需求。
中低通量测序方面,Illumina有MiSeq系统,该系统将基因扩增、测序和数据分析整合在一起,实现了测序仪的一体化,外观小巧,操作简便是开展快速、经济、高效测序的理想平台。MiSeq同样采用了HiSeq的化学原理,保证了实验的稳定性和数据的可靠性,同时,MiSeq简化了人工操作和仪器运行的时间,配备了专门的样品制备的试剂盒,使处理时间从过去的6-8小时缩短到2小时,人工操作不超过15分钟,让研究人员在8小时内就可从起始样本得到分析好的数据,更值得一提的是MiSeq强大的数据处理功能。数据处理除了可用整合在仪器内部的软件进行拼接、比对等基本分析,还可把数据上传到BaseSpace系统,利用BaseSpace中多家专业公司提供的大量数据分析软件进行数据处理,很大程度上解决了中小型客户在数据分析存储等方面的困难。
技术的创新与改进兼顾,从各检测环节入手全方位提高产品性能
Illumina公司每年在产品和技术研发上投入大量资金,旨在开发更先进的技术和应用,更好的为客户服务。
Illumina中国区销售部经理江滔先生详细介绍了研发的两大组成部分,一部分是新产品的研发,比如各种应用试剂盒,包括样品制备试剂盒、簇生成试剂盒和测序试剂盒等,及新的数据分析软件,如与MiSeq连接的BaseSpace云计算环境,不但方便世界各地的用户进行数据分析和分享,还能有效的保证使用的安全性,还有最新推出的MyGenome App软件,可在苹果的iPad上直接下载和运行,软件分为基因组图谱、健康卡、报告三部分,用户既可使用该软件将自己得到的数据和参考数据进行比对,又可查询软件中提供的所有基因的相关信息。可以直观的观察不同位置的基因变异对人体健康或生物性状的影响,也可以查阅到有关遗传变异可能引起的健康问题的250多种情况,还能用来预期不同的遗传变异位点给健康增加的风险,使得基因和医疗、健康连接的更加紧密。
另一部分是现有产品的升级、更新,如HiSeq2500是在HiSeq2000的基础上增加了快速运行模式的新功能,既满足了客户对快速、可靠结果的需求也增加了实验的灵活性,提高了实验的进度。未来,Illumina还将推出更多具有创新意义的技术和应用,包括HiSeq2500与BaseSpace的顺畅连接,MiSeq系统测序长度、测序通量的增加,在BaseSpace上实现更多数据的分析和处理等。
“硬件”与“软件”兼顾,尽最大努力为客户提供高质量服务
“Illumina一直与客户保持紧密的合作,以帮助客户用好仪器、做好应用为最终目标。”Illumina公司销售部经理江滔先生说。
对仪器的研发和改进是为了更好的满足客户的需求,在推出新仪器的同时,Illumina也为还在使用老款仪器的客户推出了一些相应的升级政策。其中,MiSeq系统从今年第三季度起开始发售升级后的新机,每次运行数据可达7.0Gb,老款用户可免费升级,升级费用由Illumina公司承担;HiSeq2500由今年第四季度起正式发货,有意愿升级的HiSeq2000用户,可在今年内以极具竞争力的价格升级成HiSeq2500,升级主要是针对一些部件的更改。
除了硬件维护,市场部经理刘雪燕女士还着重介绍了Illumina的“软件”方面。Illumina一直非常重视一点,销售给客户的是整套的解决方案而非仪器本身。事实上,Illumina也在一直帮助客户开发、拓展测序应用领域,并投入了大量的人力、物力、财力。截至目前为止,Illumina已经成功的协助客户在新药筛选、临床诊断、癌症基因检测、动植物基因组测序、生物能源等多方面取得了阶段性进展。
另外,Illumina还推出了Certified Service Provider(CSPro)业务。该业务在世界范围内选择一些拥有Illumina仪器的第三方实验室进行认证,签订合作协议,旨在建立一个拥有统一、严格标准的服务商体系,为客户提供更好的测序服务。销售部经理江滔先生表示,目前国内,华大基因已经成为Illumina的认证服务商,北京、上海还有2-3家实验室正在认证中,预计在他们成为Illumina的合作伙伴后,国内用户将会享受到更好、更及时的测序服务。
Illumina公司市场部经理刘雪燕女士还补充介绍了公司努力将科研成果向应用方面转化的一些情况。如临床诊断、治疗,疾病筛查,农业育种等领域,尤其在辅助癌症治疗方案的确立,产前诊断,一些疾病用药的疗效评估方面已经有了突破性进展。这些进展必然会带动医疗诊断行业乃至整个生命科学的革命性变化,相信Illumina公司也会一直在基因测序方面提供强有力的技术支持,加速这一历史时刻的到来。
后记:
Illumina公司无论在产品性能还是服务质量上都在同行业中处于领先水平,并以客户满意为己任不断地进行完善和提升,相信这就是Illumina得到客户广泛认可和好评的法宝,也是Illumina堪比苹果公司的信心来源。
如今,二代测序技术日新月异,已经从科研院所、大型实验室逐渐推广到中小型实验室,既预示着个人基因组时代的到来,也预示着各大基因测序公司新一轮竞争的开始。市场部经理刘雪雁女士表示,面对挑战,Illumina公司将继续努力,把读长的增加、通量的提高、数据分析的简化以及成本的下降作为研发的重点,逐步取代毛细管测序,引领生命科学研究领域的客户走入基因革命的新时代。