蔬菜所小菜蛾蛋白质基因组研究获得突破

近期，中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜虫害防控创新团队在小菜蛾蛋白质基因组方面研究取得重要突破，为阐明小菜蛾对Bt杀虫剂抗性调控网络提供了重要的遗传信息。相关研究成果在线发表在蛋白组学权威期刊《分子与细胞蛋白组学（Molecular & Cellular Proteomics）》上。
随着高通量测序技术的不断发展，上万种生物的全基因组DNA序列被测序完成。其基因组的注释主要基于预测软件和已知蛋白的同源搜索，不可避免地导致编码蛋白质基因的错误注释和丢失、假基因广泛存在。另外，由于缺少肽段等信息，大量基因被注释为未知功能或假设的蛋白质。蛋白质基因组（Proteogenomics）是一种利用蛋白质组学的相关数据对基因组进行注释校正的新方法，由于其结合了大量生物体蛋白质氨基酸信息，从而有力地弥补基因组上基因寻找和注释的不足。小菜蛾是一种世界性重要农业害虫，每年因小菜蛾造成的损失高达40亿–50亿美元。小菜蛾几乎对所有的杀虫剂均产生了不同程度的抗药性，包括微生物杀虫剂Bt。该团队利用鸟枪法高效液相色谱-电喷雾-质谱/质谱（shotgun HPLC-ESI-MS/MS）对小菜蛾幼虫中肠蛋白质进行测定，结合其基因组数据，完成了首个小菜蛾中肠蛋白质基因组分析。利用获得的小菜蛾BBMV蛋白质谱图，鉴定到了大量与小菜蛾杀虫剂抗性相关的蛋白质，同时，还纠正了小菜蛾的基因注释，鉴定了大量新基因以及新的基因剪切形式。

该项成果得到了国家自然科学基金和“863”计划等资助。论文第一作者为蔬菜所博士后朱勋，通讯作者为张友军研究员。（通讯员 李海芬）

相关链接：http://www.mcponline.org/content/early/2016/02/22/mcp.M115.050989.full.pdf+html?sid=4e5695cc-66b9-4845-bf51-aff931d6c5c3

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