Nat Commun:科学家将结构生物学研究推向大数据研究时代

刊登在Nature Communications杂志上的一篇文章中,来自圣路易斯大学的结构生物学家揭示了一个新型的数据共享“联盟”如何帮助科学家们快速分享他们的研究发现,并且从中获益。

研究者Enrico Di Cera说道,我们开发了一种新型的结构生物学数据网格,其可以帮助存储、搜索并且下载相关的结构生物学数据库,这种新型的数据存储库可以有效帮助科学家们复制早期的研究发现,并且加速后期的研究进程。而该数据库的开发将是一项革命性的进展,最终研究者们将利用众多结构生物学家们所研究的数据,从事更大规模且更加深入的研究。

X射线晶体学技术是结构生物学中的研究神器,其可以使得科学家们在原子水平的分辨率下确定蛋白质、核酸及其它小分子的结构,而理解蛋白质的结构或为阐明疾病发生的根源,以及开发新型治疗性方法提供新的思路。晶体学家们会分享他们在学术期刊上的研究发现,同时也会利用标准的数据库来进行数据的处理,这就好像蛋白数据银行一样。

这种新型的结构生物学数据网格存储库也可以利用计算集群的分布模型来支持原始实验数据的存档,而其所带来的利益包括可以快速获取原始性的实验数据来进行更深入的研究和探索等,随着数据收集过程越来越简单,以结构生物学数据网格呈现的资料文件也将会被推向主流。

当前研究中,研究人员进行了一项初步研究,对来自存储库中的数据进行分析,结果发现,该数据存储库可以有效帮助科学家们对早期实验的数据进行再处理,从而为其结果的复现提供机会,同时还可以改善当前的研究模型并且筛选出可能性的错误。最后研究者Di Cera说道,这种数据网格或将为进行高层次的结构生物学研究提供帮助,我们非常自豪可以成为这项研究的一部分,来利用大数据进行更为深入的科学研究和探索。

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