Science:揭示细胞RNA转录发生的新型分子机制
近日,刊登于国际杂志Science上的一项研究报告中,来自费城儿童医院和罗切斯特大学的研究人员通过联合研究,结合新型的大数据信息工具揭开了生命的基本过程,即揭示了关键酶类如何确定DNA上的位点来开启合成RNA的过程,相关研究或为开发新型抗菌药物以及阐明其它必要的生物学过程提供新的思路。
研究者Deanne M. Taylor博士指出,我们开发的这种算法可以帮助我们解决DNA和RNA生物学多项领域中的许多问题,理解这些基础过程或将帮助我们开发抵御细菌性疾病的抗菌疗法。文章中研究者重点关注转录过程,即细胞如何阅读DNA上的遗传信息来合成RNA,RNA聚合酶就是承担转录任务的关键分子元件,研究者揭示了RNA聚合酶如何在DNA上寻找开始行使转录过程的特殊位点。
文章中研究者对细菌进行研究,他们发现,当RNA聚合物酶结合DNA并且开始展开DNA双链后,其就会对DNA的双链进行解旋操作,直至其连接上转录起始位点,研究者称该过程为DNA解链。研究者指出,在转录起始位点的选择中为了检测到DNA的解链过程,他们开发了名为MASTER和MASTER-XL的新型实验方法,即为大规模的系统性转录最终读数(massively systematic transcript end readout)。
MASTER-XL可以同MASTER技术结合将蛋白质特殊位点的人工氨基酸通过交叉连接引入到DNA位点上,利用高通量的算法,研究者就能够准确并且快速地在成百上千万种不同的DNA序列中指出这些交联位点。这种快速的测序方法,加上先进的生物化学及化学方法或者就可以帮助揭示转录过程中DNA解链的关键机制。
如今研究人员正在进行相关的研究调查高等有机体中的特殊转录模式,同时他们还分析了是否是否在转录起始位点的选择过程中DNA解链等过程会发生,研究者希望利用上述两种先进的技术来分析其它必要的细胞过程,比如DNA复制等。