武汉植物园发现桃基因组转座元件的进化机制
发表日期：2016-03-07 04:38PM 阅览次数：
桃原产于我国，驯化和栽培历史超过三千年，桃花形态和颜色多样，集中在早春时节开放，成为春季主要的观赏景观之一，自2千多年前成书的《诗经》开始，一直是历代诗人反复歌咏的对象。而桃的果实风味美馔、营养丰富，深受人们喜爱。桃自交亲和且基因组很小（230Mb左右），但品种间的表型差异相当丰富。
中国科学院武汉植物园王鲁助理研究员在韩月彭研究员的指导下，对桃基因组中的一类hAT-MITE转座子（“磨山”转座子）的染色体位置分布、与功能基因的相互关系进行了研究。发现“磨山”转座子在桃基因组中极其活跃，拷贝数扩张到接近500份，其中39个转座子插入到基因区域。在栽培种和观赏用品种中进行的全基因组重测序比较分析发现，相对于亲缘关系很近的桃参考品种，不同的栽培或观赏用桃品种基因组中均有约200个甚至更多的“磨山”转座子新插入位点。该研究还揭示了“磨山”转座子对基因功能的调控作用，以及它本身的起源和进化历史。
研究成果以“Evolutionary origin of Rosaceae-specific active non-autonomous hAT elements and their contribution to gene regulation and genomic structural variation”为题发表于Plant Molecular Biology，揭示了转座子对于桃品种间遗传多态性的贡献，研究结果为桃的驯化历史和品种进化提供了佐证，又为桃等作物的品种差异与品种形成提供了研究工具与理论素材。
“磨山”转座子在桃基因组中的分布及其对基因表达潜在影响
