Cell：不依赖于DNA突变的新型血液检测，攻破液态活检的局限性

日前，《Cell》中的新研究揭示了克服液态活检检测范围局限性的新方法，开发出了依赖于核小体中DNA折叠的新型血液检测技术，可扩大液态活检的诊断范畴。

液态活检是检测患者血液中的游离DNA以诊断或检测疾病的进展，在过去几年中，液态活检引起了分子诊断领域的一场变革；然而尽管液态活检展现出巨大优势，但其可检测范围仍然是有限的。

在华盛顿大学的一项新研究中，研究人员表明通过确定释放游离DNA的细胞类型来克服液态活检的局限性是有可能的。然而，有趣的是新方法依赖于个体游离DNA的分裂模式，并将这种模式与各种生理状况有关的细胞凋亡做比较。该文章以《Cell-free DNA Comprises an In Vivo Nucleosome Footprint that Informs Its Tissues-Of-Origin》为题发表于《Cell》上。

本文作者霍华德休斯医学研究所Jay Shendure博士说，“我们的研究揭示了通过寻找分裂模式（而非依赖于寻求DNA突变）来确定游离DNA的组织来源是有可能的。”每个细胞中含有大量的通过反复折叠的DNA。DNA盘旋缠绕着核心组蛋白八聚体形成了核心蛋白。核小体如珠子随着基因组延伸。人体内每个细胞的DNA折叠方式都有差异，这些差异可使游离DNA带上标记。

华盛顿大学的研究人员推测可用这种方法来确定游离DNA的发源地。在细胞死亡的过程中，DNA被酶切成很多块（切断核小体之间连接脆弱的DNA片段），先前研究指出，人类基因组核小体容易被切断的位置总共有1300万个。

作者写道，“通过对血浆中的游离DNA进行深度测序，我们制成了有机体内核小体的全基因组图谱，同时发现游离DNA碎片蕴藏了转录因子的印迹。游离DNA核小体包含率（nucleosome occupancies）与细胞中核体结构、基因结构与表达密切相关，并可揭示细胞类型的起源。”

研究人员表明，不仅不同癌症有不同的核小体DNA指纹，通过这些指纹还能鉴别出肿瘤的解剖源。Shendure博士说，“这与5%的起源未知的转移性癌症尤其相关，这种测试可有助于诊断未知癌症的类型并给与治疗指导。”

该研究团队认为这种方法可用于诊断大量的疾病，同时具有有一个优势：在基因学上相同的细胞中也起作用。作者最后总结道，由于这种方法不依赖于不同组织之间的遗传差异，因此可广泛用于临床疾病的非侵入性检测。

参考文献：Matthew W.Snyder, Martin Kircher, Andrew J.Hill, Riza M.Daza, Jay Shendure. Cell-free DNA Comprises an In Vivo Nucleosome Footprint that Informs Its Tissues-Of-Origin. Cell, 14 January 2016, 164(1-2):57–68. DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2015.11.050

本文来源于：生物探索

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