Science:伦敦大学将启动“英国个人基因组项目”,数据库开放

2013年11月06日,英国伦敦大学的Stephan Beck和他的合作者宣布了一项“英国个人基因组项目(PGP-UK)”,这个项目将招募志愿者提供DNA,分析健康数据,这些数据将放在一个免费获取的在线数据库中。相关报道发表于2013年11月06日的《science》杂志上。

Stephan Beck

PGP-UK项目,计划在第一年,测定50位年满18岁的英国居民的基因序列,最终希望有100000个人注册加入,Beck说。大约450个人已经表示对此感兴趣,研究团队已经获得了一年的测序服务经费和实物援助。

英国的PGP项目,是2005年由哈佛大学的基因组科学家George Church开始的一个项目的产物。在那个时候,基因组数据经常可以免费获取,但是健康信息由于其隐私性而不能免费获取。这使得研究者很难将基因变异与具体情况联系起来。

然而,Church辩解说,由于现代电脑技术和分析方法的强大,尽管有防范措施,隐私仍然没有保障——这个预言已经被证实。作为选择之一,他和其他人支持一种更加透明的方法,在这种方法中,个人自愿将他们的遗传和个人健康数据发布到网上,不承诺匿名性。

Church的哈佛PGP吸引了超过9000个新成员,其中2900个拥有包含他们健康数据的PGP网址。这2900个人经历过广泛的教育,包括确定他们是否理解24页同意书的一个考试。除了基因组以外,一些参与者还提供了干细胞和其它细胞株的组织。

然而目前,哈佛PGP包含少于200个基因组,包括Church的基因组。“在如何得到测序的基金方面,还有一个挑战,”他承认。他的PGP包括2000美元的测序费,这些钱现在来自偶尔的个人捐助或者捐赠的测序装置使用时间。但是Church称,他正在急于招募100000个人,这是项目开始时,他称之为更加随意的一个目标。

“这些目标正好用来解释这确实能做,来确定是否有许多感兴趣的人,”Church说。他指出,这些目标已经达到,几个类似的PGP项目——在加拿大、德国和韩国——现在也在进行中或者在计划阶段。“这就像突然爆发的病毒一样,”他说。

一年前,环球邮报报道了为期两周的关于个人基因组学的加拿大PGP项目的启动,这个系列和项目出现在整个城市公共汽车广告牌上。大约500个人报名参加了加拿大PGP项目,他们的目标是在2013年末达到30个基因组,再下一年达到100个。最后,希望达到100000或者更多的参与者,这个项目的建立者、加拿大多伦多儿童医院的遗传学家Stephen Scherer称。

在加拿大,参与者自己支付了他们能力范围内承受的起的测序费用。对于下一个两年,来自多伦多大学麦克劳克林中心的经费和其它各种各样的经费由Scherer拼凑在一起,将覆盖PGP加拿大项目的整个年度预算,总计每年几十万美元。最终,他希望得到一项实质的政府资助。“问题不是钱,问题是处理这些(参与者)实验过程的人力成本,”Scherer说。

在欧洲,一项德国PGP也在进行中。韩国也启动了一个网站邀请参与者加入他们国家的PGP项目。

原文摘要:

U.K. Researchers Launch Open-Access Genomes Project

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