全球共享的基因组数据库办不下去了，怎么办？
根据Science最新在线新闻，美国国家人类基因组研究所预计退出作为基因组数据库的始祖——在线人类孟德尔遗传唯一的资助者。新一些的数据库都面临着类似的资金问题。应该怎么办？下文是生物探索列出的科学界相关人士给出的意见。
1、资金困境
作为世界上最具权威性的人类疾病相关的基因目录第五十个生日时，它面临着令人不安的变化。在接下来的几年里，美国国家人类基因组研究所（NHGRI）预计退出作为基因组数据库的始祖——称为在线人类孟德尔遗传（OMIM）唯一的资助者。谁将继承标签尚未明确。当美国国家卫生研究院（NIH）评估其数据资源时，其他NHGRI支持下更新一些的数据库都面临着类似的威胁。
伯克利加利福尼亚大学遗传学家，美国遗传学会主席Jasper Rine说：“用户关注这些免费使用的资源，包括从酵母基因组到蛋白质的一切，都是作为遗传学家和生物医学研究者日常生活的关键。”约翰霍普金斯大学监督OMIM的Ada Hamosh补充说：“如果NIH要开发新的融资模式，他们需要确保他们不会损害存在的完整性，大量使用的资源。”
2、考虑付费
NHGRI的负责人Eric Green说，尚未做出任何决定，传闻他所计划撤出其所有的资金都是不正确的。但他和其他美国国立卫生研究院的领导人正在寻找使数据<库更有效的方式，并敦促数据库考虑付费使用。
生物学数据库长期以来一直存在资金困境。科学机构经常抱怨数据库支持占用他们的研究资金中太多资源。Philip Bourne，NIH的第一副科学数据主任，估计50大NIH支持的资源（不算GenBank和美国国家医学图书馆NLM等数据库）——在NIH每年300亿美元的年度预算中需要1亿1000万美元。数据的爆炸使它们运营更昂贵。“有一个可持续性的问题。我们需要做些什么，”Bourne说。
除了OMIM，NHGRI支持模式生物的五个数据库和其他如UniProt，它拥有蛋白质功能的数据。所有的分子数据都标注着上传人从文献中收集的信息。都是一个个宝库。OMIM，始于50年前作为一个纸质资源，1995搬到网上，吸引了一年超过2300万的页面浏览量。医生用它来罕见疾病的诊断，而基础研究人员依靠OMIM和模式生物数据库搜索基因及其蛋白产物的参考。
3、寻找新办法
前一个五月，Green召集被称为这些数据库的负责人告诉他们，到2020他们需要找到新的资金选择。他说，在许多研究机构授权使用NHGRI数据库，现在NHGRI提供近3000万美元的一年的钱不够的数据库从基因组扩展到生物学数据。Green说。“我们需要考虑新的方法来经营。”
Boune的办公室的计划在NIH数据的使用来编制数据库，不过他指出，这无法成为衡量价值的唯一尺度：“你可以有一个相对小的数量的用户，但这些用户是至关重要的。”他和Green想知道是否有一些数据库可以组合以降低成本。进一步的自动化管理也许可以帮忙。但是人类仍然需要阅读论文并导出数据，部分是因为格式和术语有所不同。
4、一个范例
将部分数据转移到其他机构可以削减NHGRI的成本。并可以采用订阅模式。拟南芥信息资源（TAIR），在植物科学研究中的模式生物的核心数据库，美国国家科学基金会资助的撤资后，2013年开始收费。“我们反对非常强烈，“加利福尼亚旧金山TAIR的负责人Eva Huala说，“但最终我们转变了。”
TAIR根据个人、机构和公司使用的数据库的多少给出价格。“这是为了确保那些最受益于资源也最有贡献的一个好方法。”Huala说。作为奖励，她补充说，因为TAIR不依赖联邦政府拨款，它已不用于取悦于审稿人而可以专注于用户想要什么，主要是最新数据。
然而，这一转变需要一些重大的改变。Huala和她的工作人员离开卡耐基科学学会（曾主持TAIR）。开始创建一个非营利组织——Phoenix生物资讯来运营它。他们还必须建立会计和业务系统。
5、顾虑与期待
NHGRI资助的几个数据库对这个模式是担忧的。小鼠基因组数据库的首席研究员，Jackson实验室的Janan Eppig说：“这是有很多不实际的原因的”。一个问题是，付费可以防止人员从链接到其他数据库的基因数据。研究人员需要用他们的研究经费来订阅。Monte Westerfield在俄勒冈大学，斑马鱼模式生物数据库负责人说：“不管怎样最终还是NIH付账”。
Bourne说NIH委员会希望今年晚些时候开始考虑新的资助计划。直到NIH为美国国家医学图书馆NLM雇佣新的负责人来安置这些的焦头烂额的数据库，这些数据库的命运可能仍不清楚。
本文来源于：生物探索
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