番薯属甘薯与牵牛EST-SSR标记开发及通用性分析

通过对番薯（Ipomoea）属的甘薯和牵牛EST序列进行搜索，在319条甘薯EST序列中发现了共328个EST-SSRs，平均每20.41 kb出现1个甘薯SSR；在936条牵牛EST序列中发现962个EST-SSRs，平均每17.87 kb出现1个SSR；在检索到的甘薯和牵牛EST-SSRs中，二核苷酸重复类型的SSR最多，分别占各自检索总数的44.51%和40.64%。利用SSR-ESTs分别设计了36对甘薯EST-SSR引物和92对牵牛EST-SSR引物，其中有28对甘薯引物在8个甘薯品种中有扩增产物，13对引物扩增产物具有多态性，多态性引物占所设计甘薯引物的36.1%；42对牵牛EST-SSR引物在甘薯基因组中可以扩增出清晰的条带，其中19对有表现较好的多态性，占设计的牵牛EST-SSR引物的20.7%。结果表明，牵牛EST-SSR标记在甘薯上具有通用性，可用于甘薯基因组多样性分析。