The Scientist：2015年度十大创新产品（top 1-5）

The Scientist杂志终于揭晓了2015年的十大创新产品，评出了对科研和医学领域影响较大的测序仪、试剂盒、基因组编辑产品和其他技术。

值得注意的是，在高科技大行其道的时代一个增强版的传统技术强势逆袭：光学显微镜3D Cell Explorer不需要标记就可以揭示活细胞中的显著细节。此外，生命科学领域近来最火的CRISPR基因组编辑技术在十大创新产品里面独占两席。

Top 1：GemCode测序平台（10X Genomics公司）

如今越来越多的实验室配备了自己的DNA测序系统，比如Illumina台式测序仪。但这些测序仪只生成几百bp的读取，会丢失一些长距离基因组信息（比如结构变异、多态性和单体型）。

10X Genomics公司近年夏天发布的GemCode测序平台解决了这一问题。作为一体化的分子条码和分析工具，GemCode将大片段DNA（平均 100kb）分配到凝胶珠里，然后用特殊oligo标记这些片段。对这些oligo和DNA进行测序，就可以用分析软件重建出准确的长距离基因组信息。

这个系统目前售价为$75,000，可兼容Illumina测序仪。

点评：GemCode能与短读取测序仪兼容，很容易整合到现有的工作流程中。该平台用1.2ng材料就能给出定相的结构变异、单体型和其他遗传学信息，对于临床样本来说非常实用。

Top 2：MiSeq FGx法医基因组系统（Illumina公司）

Illumina公司今年一月份发布的MiSeq FGx Forensic Genomics System，将二代测序带入了法医实验室。法医实验室过去依赖于低分辨率的毛细管电泳测序方法，而现在他们可以享受到高分辨率的基因分型。

MiSeq FGx配备有自定义的控制软件和分析软件，以及专门的法医文库制备试剂盒。该系统分析所有短串联重复序列（STR），还追踪近两百个与法医相关的单核苷酸多态性（SNP）。MiSeq FGx能够很好的检测高度降解的DNA样本或混合性样本，解决传统方法难以处理的问题。

点评：MiSeq FGx为法医鉴定领域带来了很大的改变，使人们首次可以同时分析常染色体STR、其他类型STR和一系列SNP。

Top 3：Ion S5和Ion S5 XL（Thermo Fisher公司）

Thermo Fisher公司九月一日发布的两款新一代测序仪，为人们提供了更流畅的测序流程。从DNA到测序数据，整个过程的手动时间不到45分钟。Ion S5和Ion S5 XL在Ion Torrent技术的基础上添加了新的流体系统。据介绍，这两款测序仪得出的数据更加可靠，重现性更高，不会受到水质异常的干扰。运行该系统只需要用户准备好电源和网络连接。

Ion S5和Ion S5 XL采用即插即用的试剂，简化了测序仪的设置和相关操作。它们配备了三款新Ion芯片，Ion520、530和540芯片。S5和S5 XL型号之间的主要区别在于计算能力。Ion S5系统适合对周转时间没有限制的科研或转化实验室，而Ion S5 XL适合需要更快周转或更高通量的临床研究实验室。

点评：该产品显著简化了测序过程，用很少的样本就能快速得到测序结果，在基础研究和临床研究中都很有用。

Top 4：On Demand Deletions in Human Hap1 Cells（Horizon Discovery公司）

Horizon Discovery公司推出的On Demand Deletions人Hap1细胞系，可以根据用户要求用CRISPR-Cas9技术删除特定基因组区域。HAP1是类似成纤维细胞的永生细胞系，主要用于生物医学研究。这种细胞系的独特之处在于，它很接近单倍体，绝大部分染色体只有一个拷贝。

去年，Haplogen（现在属于Horizon公司）的人基因敲除细胞系曾被评上十大创新产品。该产品主要通过引入小插入或缺失，改变人类基因的编码区域。Horizon公司今年五月发布的On Demand Deletions细胞系，进一步扩展了基因组修饰规模（可达100 Kb），可以研究去除非编码区域的效果。在指定要修改的基因组区域之后，研究者们可以在12周内拿到细胞。

点评：CRISPR-Cas9系统为基因组编辑带来了一场革命，被认为有望问鼎诺贝尔奖。Horizon公司的精确基因组编辑产品，对转化基因组研究很有帮助。

Top 5：NanoLuc Binary Interaction Technology（Promega公司）

Promega公司19.1 kDa的NanoLuc萤光素酶报告系统采用了NanoBiT技术（NanoLuc Binary Interaction Technology），能够在活细胞中研究蛋白互作。这个荧光标记系统是围绕一对互补亚基建立起来的，发光明亮而且易于检测。与类似系统相比，NanoBiT“要灵敏得多，而且能用于难以转染的细胞，”爱荷华大学的Stefan Strack教授说。

“NanoBiT能够检测和定量非常低水平的蛋白互作，这是它与先前技术的显著差异。过去我们需要大规模过表达这些蛋白，才能看到它们的互作，”Promega公司的Keith Wood说。

点评：能够比较简便地对小规模分子动态进行更加高通量的分析。用低分子量部件改进了蛋白互作的检测，对生物学功能的干扰比较小。



本文来源于：生物通/叶予

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