Nat Methods：科学家开发出首个DNA精确模拟平台
近日刊登于国际杂志Nature Methods上的一项研究报告中，来自巴塞罗那生物医药研究所的研究人员开发了多种方法，其或许可以帮助在时空尺度更好地理解生物大分子的行为，尤其是核酸分子，这对生物医药和生物技术或将带来巨大的应用潜力。
分子动力学是一种可以模拟DNA运动的技术，DNA的运动包括折叠形成双股、三股或者四股链条，甚至是同蛋白和药物进行相互作用；分子动力学技术常被用于描述发生于皮秒到分钟时间的分子事件，其也可以被用于不同尺寸的分子系统研究中。
近日刊登于国际杂志Nature Methods上的一项研究报告中，来自巴塞罗那生物医药研究所的研究人员开发了多种方法，其或许可以帮助在时空尺度更好地理解生物大分子的行为，尤其是核酸分子，这对生物医药和生物技术或将带来巨大的应用潜力。
文章中研究者实现了在高精确的情况下在原子水平上对DNA的动态进行模拟，目前研究人员可对超过100个DNA系统进行检测；相关的研究数据储存于一个公共站点上，其包括了超过4TB的信息量；文章中研究人员开发了一套称为力场的数学函数，其可以描述形成DNA的原子运动方式，而力场此前并未允许在时间尺度上进行不同结构的研究来帮助理解生物现象的发生机制。
研究者发布了首个用于模拟核酸分子的在线工具，其可以帮助预测DNA的特性，从而同其它实验结果相比较，该工具具有较为广泛的应用价值，对于从生物医学领域到纳米生物技术等领域都有着非常重要的价值，其可以帮助科学家们揭示DNA的调节机制，为设计新型药物来直接或间接靶向作用DNA提供思路。
研究者Modesto Orozco教授指出，在模拟研究中的技术改进可以帮助我们定义或设计新型的理论模型，来对细胞生命的重要环节进行模拟，从而基于物理学和化学的基本原则来描述有机体行为发生的机制。
参考文献：Ivan Ivani, Pablo D Dans,, David A Case, Modesto Orozco. Parmbsc1: a refined force field for DNA simulations. Nature Methods (2015). doi:10.1038/nmeth.3658
本文来源于：生物谷
欢迎关注中科紫鑫人事招聘相关信息：http://www.ngscn.com/index.php/Job/employ
