中国科学家Nature子刊发布新基因组图谱

导读:

来自中国农业科学院、中科院上海生命科学研究院的研究人员报告称,他们通过测序705个不同的芝麻品种构建出了一张芝麻基因组单体型图谱,获得了与芝麻油产量和质量相关的一些遗传发现。这项研究发布在10月19日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。

来自中国农业科学院、中科院上海生命科学研究院的研究人员报告称,他们通过测序705个不同的芝麻品种构建出了一张芝麻基因组单体型图谱,获得了与芝麻油产量和质量相关的一些遗传发现。这项研究发布在10月19日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。

中国农业科学院油料所芝麻创新团队首席科学家张秀荣(Xiurong Zhang)以及中科院上海生命科学研究院的Xuehui Huang是这篇论文的共同通讯作者。

人类依赖于含有丰富淀粉、油脂和蛋白质的农作物来获得食物及饲料。在禾本科植物中,许多禾谷类作物(如玉米、小麦、水稻、大麦和高粱)都成功地接受了驯化,可生成大量富含淀粉的谷物种子。当前用来获取种子油的种植油料作物大多为双子叶植物,包括油菜籽、花生、大豆、向日葵和芝麻等。尽管全球对于植物油的需求在不断上升,相比禾谷类作物,油料作物的遗传调查相对有限。

在这些油料作物中,芝麻含油量高(种子中约为55%)且具有一个小的二倍体基因(~350 Mb),使得它成为了一个有吸引力的遗传研究物种。人们认为芝麻油有益健康,因此它在许多国家都非常受欢迎。作为最古老的作物之一,芝麻广泛种植于许多热带和亚热带地区。在长期的自然和人工选择下加上广泛的地理分布,芝麻具有大量不同的物种,有可能是遗传调查和育种重要的资源。

在这篇文章中,研究人员通过测序705个不同的芝麻品种构建出了一张芝麻基因组单体型图谱,并从头组装了两个代表性的品种鉴别出了一些序列变异。他们调查了4种环境中的56个农艺性状,鉴别出了549个相关位点。调查主要位点鉴别出了46个候选致病基因,其中一些基因与油量、脂肪酸生物合成及产量有关。几个决定油量的候选基因编码了与油代谢相关的酶。在种皮中两个与木质化和黑色素沉着相关的主要基因也与油量的大幅度变化相关。

这些研究结果为育种及改良广泛的油料作物指出了一些新策略。

作者:何嫱

本文来源于:生物通

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