世界首个梨全基因组序列图谱绘制完成
华大基因,2012年6月6日
由南京农业大学梨工程技术研究中心、深圳华大基因研究院、浙江省农业科学院、美国伊利诺伊大学等7所国内外科研院所、60多位基因组研究人员组成的“国际梨基因组合作组”通力合作,成功绘制完成世界首个梨全基因组序列图谱。本研究成果为培育高产、优质、低投入的新品种梨奠定了坚实的遗传基础,并为开展蔷薇科果树的比较基因组学以及进化研究提供了丰富的数据资源。
我国是梨的起源地,也是世界第一产梨大国,年产量占世界总量的60%以上。梨在我国的种植和分布范围非常广,除海南省、港澳地区外其余各省(市、区)均有种植,是仅次于苹果和柑橘的第三大水果。多年来,梨的分子生物学以及基因组学研究相对滞后,限制了基于功能基因挖掘和利用的定向育种以及分子遗传研究发展,已成为梨产业提升和科技进步的主要瓶颈之一。
“国际梨基因组计划”于2010年4月正式启动。经过2年时间的测序、组装和注释等工作,他们成功绘制完成“砀山酥梨”的全基因组图谱。砀山酥梨是目前中国、也是世界栽培面积最大的品种。研究人员通过新一代高通量测序平台,高质量地完成了高杂合、高重复序列的二倍体果树基因组组装,其组装长度约占梨基因组全长的97.1%,通过高密度遗传连锁图谱实现了与17条染色体的对应关系。目前组装数据已上传至“梨基因组计划”网站:peargenome.njau.edu.cn,并已于5月25日对外公开。
国际梨基因组合作组组长、南京农业大学梨工程技术研究中心主任张绍铃教授指出:“梨全基因组测序为揭示梨的自交不亲和性、树体生长发育规律、果实发育及品质形成、抗病虫、抗逆境等生物学特性的分子机制,以及重要功能基因的挖掘开辟了新的途径,同时,也为梨产业的健康、可持续发展奠定了坚实的遗传学基础。”
华大基因执行院长王俊教授指出:“全基因组测序的完成是探索梨这一重要水果的遗传特性的重要一步。我们希望能够同全球科研人员一同携手,共同破译百万个重要经济和科研价值的动植物基因组,有效挖掘基因资源,带动系统研究,进而推动农业、环境等发展,造福社会。”