利用建模工具发现控制植物应激反应基因

发表日期：2015-10-11 01:50AM 阅览次数：

一个来自北卡罗来纳州立大学和加利福尼亚大学戴维斯分校的研究人员组成的跨学科团队开发了一种建模算法，可以识别植物中具有特定生物功能的相关基因，包括对干旱、高温、和其他环境压力的反应。

北卡罗来纳州立大学电气和计算机工程教授Cranos William认为，该算法促进了生物建模技术，对个体基因参与特定的生物反应提供进一步了解。

为了使模型发挥作用，该团队以拟南芥植株作样品以观察哪些是活跃基因，以及它们的活跃程度。研究人员发现了2700个基因的活动，并提出了931种可能的转录因子靶基因的关系。

这是非常大的测试工作，但该算法把转录因子与靶基因缩小到32，进而预测其影响关系。研究人员发现七个预测基因中的四个与转录因子相关。他们还发现，17/32的预测影响关系是准确的，合53%。