布鲁克召开OMICS研讨会 探讨组学难题
10月31日,布鲁克公司在北京神州国际酒店召开“布鲁克OMICS2013研讨会”,会议主题为“解决OMICS难题”,来自北京科研院所、高校等机构的用户共150余人参加了此次研讨会。布鲁克道尔顿中国北方区销售经理鲁静、布鲁克道尔顿中国应用技术和市场部经理张欣怡博士等出席会议。
“OMICS2013研讨会”是布鲁克策划的系列巡讲,布鲁克公司特别邀请来自布鲁克法国的Pierre-OliverSchmit博士、来自布鲁克德国的AikoBarsch博士及来自美国的ShannonCornett博士分别介绍蛋白质组学、代谢组学及MALDI成像研究的最新进展,以及组学研究所面临的挑战与趋势。此前该巡讲已经在中国计量科学院及中科院大连化物所举办。
AikoBarsch介绍说,“过去,科学家都研究单一蛋白或代谢物,后来发现单一研究很难给出完整的信息,随后各种组学,如基因组学、转运组学、蛋白质组学、代谢组学就相继出现。而到了今天,单一组学研究给出的信息也很有限,并不能回答很多表达信息。于是,将各种组学组合起来的系统生物学成为了‘OMICS’研究的新趋势。”
“基因组学、转运组学已经有比较成熟的分析方法,但蛋白质组学和代谢组学的研究难度还较大,分析对象非常复杂,以蛋白质组学为例,蛋白含量差别很大,如何能看到尽可能多的蛋白就是一个很大的挑战。”AikoBarsch补充道。
Pierre-OliverSchmit认为,“面对如此复杂的分析对象,首先需要整合测试技术,如质谱、核磁共振波谱仪(NMR)、红外光谱(IR)等技术,现在单一的技术未必能解决科学家的研究问题;另一方面则是要提高每种技术的灵敏度、分辨率,这样才能给研究者提供更全面的信息,以便研究者能将信息整合、拼接,从而能更好地解读信息所代表的意义。”
就蛋白质组学和代谢组学的研究趋势,AikoBarsch说,“第一趋势是从鉴定发展到定量,目标物定量;第二个趋势则是从事蛋白质组学研究的科学家也开始转向代谢组学研究;第三个趋势则是从事代谢组学研究的科学家,在研究中发现了某些生物标志物,转而再研究目标蛋白研究。”
AikoBarsch表示,“目前还没有哪一种软件可以将各大组学研究数据整合在一起,但这是未来发展的一个趋势。”
相比于质谱、NMR等技术,MALDI成像技术是近年来发展起来的一项新技术,MALDI成像技术最大优势是可以获得空间信息,其可以知道蛋白、药物代谢产物在机体中的位置,以及药物是否在目标部位发生了作用等。
ShannonCornett告诉仪器信息网,“MALDI成像技术最开始主要用于临床研究,以发现生物标志物,以此预示其与某种疾病相关。而现在MALDI成像技术在药物研发领域应用发展较快。”
谈及该项技术面临的挑战,ShannonCornett说,“其一,如何更好地防止待监测的目标物不在样品制备过程中移位;其二,要进一步改善分别率,现在通过MALDI技术,我们不能确定一个蛋白在细胞中的位置;其三,MALDI成像技术产生的数据非常庞大,需要有更好的数据处理软件。目前,绝大多数MALDI成像研究以获得二维图像数据为主,未来的趋势是如何整合三维图像,这也是布鲁克软件研发部门正在与相关研究单位合作研究的重点之一。”(撰稿:杨娟)