甘蔗所科技人员到中科院遗传所进行交流学习

云南省农业科学院甘蔗研究所科技人员刘洪博于2015年8月11日至9月10日到中国科学院遗传与发育生物学研究所陈明生老师课题组进行交流学习，该课题组主要开展水稻各种间的系统进化分析、基因组学和转录组学的比较研究，在水稻着丝粒、常染色质和异染色质区域的比较基因组学研究处于国际领先水平。为进一步了解和学习植物基因组学研究和功能标记的开发应用，刘洪博与课题组人员探讨了基因组学的比较分析的方法、不同种间染色体着丝粒、常染色质和异染色质间的变化特点，植物基因组中LTR类反转座子对植物性状与功能的影响及其差异性状基因功能标记的开发等内容。组学的比较研究主要基于linux系统进行操作，研究人员同时要具备分子生物学、生物信息学、统计学、计算机编程等基础知识，根据植物基因组中不同基因、intron、extron、转座子类型的特点等进行程序设计，然后对全基因组进行扫描分析。针对甘蔗基因组没有测序，课题组人员推荐利用de novo从头测序的方法可以开展一定研究；根据多倍体植物转座子的类型和特点，建议在功能标记的开发中注意LTR类转座子对植物功能性状的作用。在与刘铁燕老师学习了转基因载体、RNAi沉默载体的构建后，经课题组的同意，将两个载体带回甘蔗所以进行进一步学习和研究。

期间，还参观访问了中科院植物所，并与李振宇研究员进行了两天的交流学习，探讨了甘蔗属及其近缘属植物的系统进化和系统发育方面的认识和理解，并与课题组成员向小果博士进行了交流，讨论了甘蔗属系统进化研究方面研究合作的可行性。

通过本次的学习，了解了植物比较基因组学和系统进化方面研究的最新进展，学会了DNAseq、Bio editor等软件的使用、载体的构建等，为甘蔗功能基因标记的开发和科研工作提供了思路。（审核人：郭家文）

（图1 参加遗传所的学术交流活动）

（图2 到植物所交流学习）