中国科学家首次测序大鲵虹彩病毒全基因组序列揭示其分子特征

中国研究人员对大鲵虹彩病毒的全基因组序列及其结构变化开展研究,在新分离鉴定导致大鲵致死性出血病病原——大鲵虹彩病毒的基础上,测定了其全基因组序列,并与已知两栖类蛙虹彩病毒基因组进行点阵及结构变化分析。这项研究由中国科学院水生生物研究所张奇亚研究员、桂建芳研究员和南昌大学洪一江教授共同完成。相关文章发表于2013年10月21日的《Veterinary Research 》杂志上,第一作者为陈中元博士,通讯作者为张奇亚研究员。

大鲵 (或称娃娃鱼) 是世界上现存最大的濒危珍稀两栖动物,为我国所特有、被列为国家二级保护野生动物。虹彩病毒在全球范围普遍流行,是侵染众多鱼类、两栖类及爬行类等水生动物的重要病毒病原。

有证据表明,虹彩病毒是包括蛙和大鲵在内的两栖类自然种群显著下降或消亡的原因之一,而鉴定虹彩病毒病原并阐明其基因组结构特征是研发相应病害防控技术的前提。

研究结果表明,大鲵虹彩病毒(Andrias davidianus ranaviurs, ADRV)基因组全长为106,734 bp,可编码101个开放阅读框,其中含虹彩病毒家族26个核心基因、蛙病毒属成员24个特有基因及两栖类蛙病毒亚属的11个特有基因;发现几个涉及病毒毒力及宿主感染性的关键基因发生显著变化。

研究人员进而指出,在大鲵虹彩病毒基因组中有明显变化的这些基因可在削弱或改变宿主抗病力、增强ADRV致病性以及跨种传播中起关键作用。

该研究不仅首次揭示导致大鲵自然种群衰减与养殖群体疾病频发的虹彩病毒分子特征,也为深入了解这类病毒流行和基因组进化规律、以及研发两栖类病毒病免疫防控技术提供了新的研究思路。

该研究得到国家基础研究973计划和自然科学基金等项目资助。

文章链接:

Genome architecture changes and major gene variations ofAndrias davidianus ranavirus (ADRV).Zhongyuan Chen, Jianfang Gui, Xiaochan Gao, Chao Pei, Yijiang Hong andQiya Zhang.Veterinary Research 21 October 2013;doi:10.1186/1297-9716-44-101

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