疣粒野生稻中白叶枯病抗性等位基因克隆和生物信息学分析

水稻白叶枯病是水稻生产上的主要细菌病害之一。疣粒野生稻具有对白叶枯病高抗，甚至免疫的特性，从中发掘优异的抗白叶枯病基因，可以拓宽栽培稻白叶枯病抗性遗传基础。本研究通过转录组测序和3’/5’ RACE方法，从疣粒野生稻中克隆了两个白叶枯病抗性等位基因Omxa5和Omxa13的cDNA全长，并对其编码的蛋白质进行了详细的生物信息学分析。结果表明，疣粒野生稻与短药野生稻间亲缘关系最近。蛋白结构分析表明，Omxa5和Omxa13与水稻同源蛋白xa5和xa13具有相同的保守结构域。结合疣粒野生稻对PXO99菌株免疫的表型(未显示)，我们推测Omxa13蛋白MtN3.1结构域的氨基酸突变，影响其与Cu转运蛋白COPT1和COPT5的相互作用，使寄主木质部维管束中维持相对较高的Cu浓度，抑制细菌的生长。