生物所在高通量简化测序技术研究领域获得突破

“AFSM技术，是目前为止全世界唯一的可以在全基因组高通量检测SNVs的同时检测甲基化位点的方法，具有其它简化测序无法比拟的优势。”AFSM技术发明人、生物所青年科学家夏志强博士告诉记者。

近日，生物所在高通量简化测序技术研究领域获得突破，种质与基因资源研究室夏志强博士发明了AFSM技术，能够提供世界领先的简化测序和甲基化解决方案，相关成果已发表于Nature旗下子刊Scientific Reports（Xia et al., 2015; IF: 5.578），并申请了国家发明专利（专利号：201410154134.9）。AFSM技术通过对酶切获得的AFSM-tag进行高通量测序，能够降低基因组的复杂度，操作简便，同时不受参考基因组的限制，可快速鉴定出高密度的SNVs与甲基化，用于遗传连锁图谱的快速构建、QTL定位、自然群体演化与结构分析、全基因组关联GWAS分析和快速进行群体表观遗传学甲基化研究。

夏志强博士在做实验

相比世界范围内其它高通量简化测序技术，它具备五大优势：一是适用对象广泛，其研究对象有无参考基因组均能适用；二是精确度高，每个Tag 的平均覆盖深度至少达到5倍，保证分子标记的高准确性；三是性价比高，它基于简化后的基因组DNA测序，测序和甲基化检测成本均较低，特别适合大样本量研究；四是快速高效，只需3-4个月即可完成大样本的群体研究；五是甲基化检测优势，能够在全基因组水平大规模高通量检测甲基化。
据了解，该技术问世后，生物所已收到来自国内外多家科研机构的合作意向，并成功与相关研究机构签订了AFSM技术服务合作协议。目前，AFSM技术已在木薯、胡椒、柱花草、马铃薯、水蜜桃、火龙果等植物基因组研究中得到应用。

AFSM技术路线图

AFSM技术相关论文：
Xia Z, Zou M, Zhang S, Feng B, Wang W. AFSM sequencing approach: a simple and rapid method for genome-wide SNP and methylation site discovery and genetic mapping,Scientific Reports,2014,4:7300,DOI:10.1038/srep07300

;