宁夏农业生物技术重点实验室首次构建了马铃薯和枸杞测序序列数据库

为深入剖析马铃薯和枸杞目标性状形成的分子调控机理，加速对这两种植物的功能基因组学和分子育种研究进程，宁夏农业生物技术重点实验室通过两年的时间将宁薯4号和宁杞1号的核酸测序数据搭建成网页版数据库（http://genedenovoweb.ticp.net:81/gmdb/index.php），并在线公开使用。网页版序列库的建成填补了区内从大数据层面解析特色农作物和经济植物生长发育和分子育种的研究空白。
核酸序列是研究核酸和蛋白质结构、功能等生命本质的基础，在分子生物学及相关学科研究中有着广泛的应用。传统的Sanger测序已经不能完全满足研究的需要，以边合成边测序、费用低、通量高、速度快、准确度高为技术特点的第二代测序技术在解析核酸序列、发掘功能基因、研究性状形成分子机理、开发分子标记等领域应用日益广泛。随着基因测序技术的飞快进步，使得“精准农业”成为可能，但大数据伴生的是如何高效管理和分析所得到的序列，并建立起表型与分子、核酸序列相配套的数据库，使其尽快转变为能服务生产的科研工具。
宁夏农业生物技术重点实验室与华大基因和基迪奥生物等公司合作，将本实验室已有的马铃薯和枸杞高通量测序结果和已公开的马铃薯基因组、转录组信息合并并定制开发成符合自身目地的“mini-NCBI”，使之在查找目标基因序列、比较研究基因功能等方面发挥载体平台作用，具有可视化程度高、操作简便、查询结果准确等特点。数据库的建成使用将充分发挥其数据平台的作用，为自治区两大特色优势产业的快速发展提供有力的科技支撑作用。
数据库建设得到宁夏回族自治区农业育种专项“马铃薯新品种选育”（2014NYYZ01）、宁夏自然科学基金 (NZ13098)、宁夏农林科学院科技创新先导资金 (NKYJ-13-05，NKYG-14-05，NKYG-15-06)和植物分子遗传国家重点实验室开放课题（O809Z511C3）等项目的共同资助。