全球专家学者深圳商讨制定基因组标准
第13届基因组标准协会会议7日在深召开,这是该协会首次在中国举办基因组标准会议。
来自全球基因组学领域的百余名专家学者参加了本次会议,并从动植物、微生物、生态环境等领域汇报了基因组标准化的最新研究进展,亦对海量基因组数据处理分析、存储交换以及可重复性研究中数据分析处理的标准和政策等问题展开了全方位的讨论。
英国生态与水文研究中心的Dawn Field教授指出,基因组标准协会的主要目的在于推广全球范围内基因组数据的交换与整合,推动基因组学研究的标准化。他说,测序通量的提高和测序成本的降低使得越来越多的物种的基因组被测序,由此产生了海量的基因组学数据,如何充分利用这些数据将会成为下一阶段科学家们所关注的重点,同时,与其相关的标准、政策的建立也将成为最关键的一步。
生物信息学是当前生物学领域的研究热点,在基因组数据分析、处理等方面发挥着非常关键的作用。大规模测序是基因组研究的最基本任务,其中每一个环节都与信息分析密切相关。从测序仪的光密度采样与分析、碱基读出、载体标识与去除、拼接与组装、填补序列间隙,到重复序列标识、读框预测和基因标注的每一步都是紧密依赖于基因组信息学的软件和数据库。目前,科研人员可以轻易获取大量的基因序列和完整的基因组图谱,然而,许多基因组学和生物信息学资源都并未能被充分利用,其主要原因是由于不同的表现形式、数据类型及不统一的名称,使得很多数据很难被充分利用。因此,讨论制定基因组学研究中的各项标准和政策迫在眉睫。
芝加哥大学、阿尔贡国立实验室的Jack A Gilbert教授在致辞中表示,希望通过大家的共同努力,建立基因组数据分析管理等相关标准,从而促进基因组学的进一步发展。
本次会议邀请了芝加哥大学、阿尔贡国立实验室、美国海洋生物研究所、美国国家生物技术信息基因库中心、英国生态与水文研究中心、英国牛津大学、英国曼彻斯特大学和美国马里兰大学等科研院所的众多知名专家作近60场专题报告。