Nature Genetics:中国农业科学院构建黄瓜全基因组遗传变异图谱

中国农业科学院的研究人员通过对115个黄瓜品系进行了深度重测序,构建了包含360多万个位点的全基因组遗传变异图谱。这项研究是由中国农业科学院蔬菜花卉研究所国际黄瓜变异组完成的。这一项目为全面了解重要蔬菜作物黄瓜的进化及多样性提供了新思路,并且为全基因组设计育种打下了基础。相关文章发表于2013年10月20日的《Nature genetics》杂志上。

黄瓜源自喜马拉雅山脉南麓,本是印度境内土生土长的植物,如今已成为品种多样、在世界范围内普遍种植的蔬菜。在科研上黄瓜常被用来作为研究植物性别决定、维管束形成的重要模式系统。自2009年蔬菜花卉研究所发表黄瓜全基因组序列图之后,科研人员对黄瓜展开了更深入的探索。

研究人员发现黄瓜基因组中有100多个区域受到了驯化选择,包含2000多个基因。其中7个区域包括了控制叶片和果实大小的基因,果实失去苦味的关键基因已经明确地定位在染色体5上一个包含67个基因的区域里,为下一步克隆这一重要蔬菜驯化基因打下了基础。

原文检索:

A genomic variation map provides insights into the GENEtic basis of cucumber domestication and diversity.Jianjian Qi, Xin Liu, Di Shen, Han Miao, Bingyan Xie, Xixiang Li, Peng Zeng, Shenhao Wang,Yi Shang, Xingfang Gu, Yongchen Du, Ying Li, Tao Lin, Jinhong Yuan, Xueyong Yang,Jinfeng Chen, Huiming Chen, Xingyao Xiong, Ke Huang, Zhangjun Fei, Linyong Mao, Li Tian,Thomas Städler, Susanne S Renner, Sophien Kamoun etal. Nature Genetics. 20 October 2013;doi:10.1038/ng.2801

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