烟草NtAGO4及NtAGO6基因的鉴定及其特征分析

DNA甲基化是一种重要的遗传修饰现象，植物中DNA甲基化主要是通过RNA介导的甲基化路径(RNA direct DNA methylation, RdDM)而建立。其中ARGONAUTE 4 (AGO4)和ARGONAUTE 6 (AGO6)基因是该路径中重要的功能基因，它们能够结合24 nt 的siRNA，目前烟草(Nicotiana tabacum L.)中尚无这2个基因的报道。本文根据拟南芥(Arabidopsis thaliana) AtAGO4及AtAGO6的蛋白序列，通过同源比对烟草基因组数据库鉴定出烟草7个NtAGO4及2个NtAGO6候选基因。根据烟草基因组测序和转录组测序数据，预测了烟草NtAGO4及NtAGO6基因结构，结果表明候选基因具有相似的基因结构，均具有PIWI保守结构域。采用MEGA 6.0软件构建进化树，发现栽培烟草具有NtAGO4及NtAGO6候选基因。目前关于烟草基因信息的研究比较少，本研究丰富了对烟草AGO4及AGO6基因的认识。