Structure：一种有效的探索蛋白质构象改变的方法

生物谷,2012-05-21

蛋白质动力学在蛋白质功能、酶催化活性和发病机理等方面起着重要的作用。因此，人们对计算方法探测蛋白质的构象变化有很大的兴趣。但是分子动力学模拟在计算上代价高，因而被仅限于相对短的时间尺度。

5月10号，国际著名期刊Structure在线发表了哥本哈根大学生物学系生物信息学部等科研机构的一篇题为An Efficient Null Model for Conformational Fluctuations in Proteins的研究论文，介绍了一种用于探索蛋白空间构象的概率统计新方法TYPHON。

TYPHON是一种用于探索蛋白空间构象的概率统计方法，它在蛋白局部结构的复杂概率模型和特定的描述非局部相互作用约束装置的指导下进行。TYPHON用多种复杂的概率统计模型维持蛋白局部结构，并用简单的高斯限制维持相关的非局部结构。

TYPHON能提供蛋白构象改变的信息，这种信息与实验测量结果一致。TYPHON为探索蛋白质可能的构象改变提供了一种灵活的、但计算上有效的方法。