生物信息学：其它物种为人类生物学服务
生物探索,2012-05-21
SIB瑞士生物信息研究所和EMBL欧洲生物信息研究所的研究人员声称，对人类和其它生物共有基因的研究是非常有用的。这一研究表明生物信息学有望探索出生命科学依托的根本原则，并发表在5月17日PLoS Computational Biology 期刊上。
对模式物种基因的研究在整个生物学领域提供了宝贵的认识
通过对基因的研究，生命科学研究人员理解机体如何运转以及疾病如何形成。长期以来，科学家们研究模式生物以理解人体生物学，例如小鼠，这是“同源猜想”的基础：我们从一些物种中获取知识，然后应用到更多的物种上。
同源猜想
了解同源概念，让我们认识一下犬齿。我们可从狼的犬齿学习更多以加深对对人类犬齿和臼齿的认识，可能这一回答不太直接。遗传学上，科学家解决这类问题：最好比较来自同一祖先的人类和小鼠的基因（称为“同源性”），或者比较人类的不完整基因拷贝（“旁系”）。
同源性推测
40年来，科学家从事相当奏效的同源性策略。对模式物种基因的研究在整个生物学领域提供了宝贵的认识，但是截止到现在，缺乏足够的数据以权威性回答这个问题。随着生物技术的进步，每天产生的大量数据最终能解决这一争议。
通过先进的计算技术，研究人员从大量科学论文的数据中分析13个物种的40万对基因（同源和旁系）。研究人员比较了2种方法，并选择1个较好的。
洛桑大学Marc Robinson-Rechavi 教授称：“我们的数据证明，同源性的研究确实有用，但这只是个开始，它处于比较基因组学的中心位置，我们可从少数生物体中推断一些知识，然后将其应用到所用生命体中。”
EMBL欧洲生物信息研究所Christophe Dessimoz称：“我们发现，目前的实验注释支持这一标准模型，此外，我们将致力于证实这一假设——研究其它物种的基因可阐明人类生物学的各个方面，如小鼠、酵母和细菌。”
美国印第安纳大学Matthew Hahn及其同事最近解决同样的问题——不同的结论引起一些争议。对基因功能的认识偏差引起这些争议，通过控制该因素，新研究明确支持同源猜想，以及人类的远缘性物种（甚至蠕虫、苍蝇、酵母菌或细菌）是相关、有用的。
欧洲生命科学数据基础设施大力支持信息的公开性，所用的研究数据将免费公开，包括基因组序列和实验知识。ELIXIR将巩固这一传统，并在欧洲和世界范围内打造下一代生物信息基础设施。
