《转》访祁鸣教授:全基因组测序的检测报告与遗传咨询
导读:
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转化医学网:请祁鸣教授先给我们科普一下基因和健康的关系?
祁鸣:大家知道基因组是生命的蓝图,健康/疾病=基因+环境因素,这个是相互作用的结果。基因突变能够导致疾病,我们称之为健康/疾病的内因。根据不同的疾病和情况的发生,我们可以知道这些内因。一些变异足以导致疾病,称为致病基因;另一些变异可能增加患病的风险的基因,常称之为易感基因。而因交通意外伤亡就是作为环境因素的健康/疾病的纯外因起决定性作用了。
转化医学网:欧美国家基因检测的现状是怎样的?
祁鸣:目前,在欧美发达国家,基因检测已经逐步成为了临床服务上非常常规的组成部分,如同其他各种各样的临床检测。像美国哈佛医学院系统的附属医院,从2008年开始已经把基因检测列入他们电子病历的组成部分,医生所开的一些处方需要在基因检测结果有了以后,才能决定是不是可以开药,以及所开的药的剂量多少比较合适—这就是所谓的个性化治疗,精准医疗。遗传信息的改变可能导致疾病的发生,比如说唐式综合症,就是染色体的数目发生了改变。相对很微小的基因突变也可以导致癌症的发生,比如美国影星安吉丽娜·朱莉预防性乳腺切除。中国陈晓旭也是因为乳腺癌而去世,这可能与基因突变相关。
转化医学网:基因检测将如何应用于医学遗传学?
祁鸣:基因检测运用于人类和医学遗传学其实就是基因组科学信息与技术检测特定人体基因。若是针对具某些临床症状但尚未能确诊的病人进行检测称为基因诊断,可为临床大夫提供确诊和治疗方案制定的依据。若是针对尚无任何临床症状,但欲了解定发病风险的受者进行检测,称为疾病风险预测基因检测,可为受检者/保健医生提供保健方案定制的依据,这类检测以往通常针对高危人群施行。而随着现在基因测序以及其它各种各样的检测技术的提高和费用的迅速下降,现在疾病风险的预测已经拓展到非高危人群,即一般人都可以通过基因检测/测序了解自己发病的风险,这个基因检测包括我们现在的全基因组检测。
过去,医学上的基因检测定义是检测基因的某一部分,或某一个基因。现在随着基因组技术的发展,我们可以将基因检测发展为基因组合或全基因组的检测,并向企业化、工业化发展。但是,在这个过程中有一个很大的瓶颈,那就是大数据的收集,分析和解读,最后让它服务于临床。
转化医学网:一个完整的基因检测临床报告应该包含哪些内容?
祁鸣:首先,单个基因或者少数基因检测的临床报告内容。1、检测机构信息(是否有一个比较良好的信誉,有合法的资质);2、受检者具体的信息(性别、籍贯、家族病史、个人病史,对于后面结果报告的解读是非常重要的);3、送检机构/医师信息;4、检测的样本信息(是外周血,还是头发毛囊摘是肿瘤的组织);5、样本送到日期;5、检测报告日期;6、检测项目;7、检测结果;8、检测结果的解读;9、根据解读,提供下一步的建议;10、检测的科学背景;11、检测数据/图像;12、检测方法和适用范围;13、参考文献;14、检验报告执行者,报告结果核对者和报告终审及签发者。
发现意外的致病基因要不要告知受检者
全基因组测序检测报告和前述的报告有一定的相似性,但全基因组检测与单基因组检测也有不同。全基因组检测可能会有意外发现,有可能发现患者/客户所关注的基因以外的疾病基因,那么这个”意外“的结果我们要不要报告给病人呢?这就需要事先了解客户有没有个人的禁忌,如果有禁忌,我们的报告就不能够轻易披露有关禁忌的信息。
缺乏遗传咨询的全基因组检测满意度都比较低
全基因组检测若没有特别的临床指征或检测目的,通常会把这样的检测结果放在检测报告的前面。第一,回答与该客户个人病史或者与家族史相关的问题;第二,检测出增加客户患病风险的基因突变;第三,和本人健康没有关系,但跟后代发病风险有关的基因突变。除了把这几个结果优先报告以外,报告还有大量的信息,包括人体的情况,老年病情况,心血管的情况、肿瘤的情况等。我们可以按照这些系统地进行排列,这样就可以便于查询,也可以用于用药指导。然而做这样的一个全基因组检测,如果没有遗传咨询,客户满意度基本上都比较低。这就是说,我们非常需要遗传咨询这项服务。
转化医学网:我们已经了解了遗传咨询师的重要性。目前国内还没有发展起来,请为我们介绍一下国外遗传咨询师的情况。
祁鸣:美国医学遗传学学院院长指出,未来基因检测的费用可能可以下降到100美元,然而其报告解读却可能需要花费1万美元。
遗传咨询师属健康医务专业人员,在学术与临床方面均有能力为个人或家庭提供关于出现某种遗传疾病或先天型缺陷或其发生风险方面的基因概况。美国遗传咨询师认证行会,专门认证培训和机构遗传咨询师,全美有32个遗传咨询师机构培训遗传咨询师。美国2015年已有3475名注册遗传咨询师(美国遗传咨询师(国家)认证行会)。有专家提出,美国有多少律师就应该有多少遗传咨询师。
转化医学网:具体来讲,如何咨询、解读某项基因检测项目及其报告呢?
祁鸣:我们在检测前要进行遗传咨询,获得受检者的知情同意。让他们知道检测的目的是什么,为何要做这个检测/筛查。适应症:临床指征,发病风险/再发风险。检测之后有遗传咨询。需要了解检测的基本原理,科学背景、有无遗传异质性外显度。敏感性和特异性、检测范围、报告时间。对检测后也需要遗传咨询,要让受检者了解检测结果,知道怎么样进行干预。最后注意遗传隐私的保护。遗传咨询是专业性非常强的一项工作。根据我国目前的情况,我认为我们需要不同层次的遗传咨询师:达到国际标准的遗传咨询师(可国内授课、去美国临床实习),全科遗传咨询师(硕士:2年全职或零存整取),专科遗传咨询师。
转化医学网:您开创了国内首个“基因门诊”,这也是遗传咨询落地的一个实践,请给我们简单介绍下基因门诊的运行情况。
祁鸣:我们的“基因门诊”并非仅仅面对某一个科室服务,实际上是面对所有科室服务的。基因门诊自开设十年来,已经服务了近万名位病人,这些病人分别来自妇产科、儿科、肿瘤科、眼科、心内科、骨科等,其中分布最多的科室是妇产科和儿科。
基因门诊不仅是我们团队在咨询,实际上已经成为对外交流的一个窗口和品牌,很多国外著名的教授专家都应邀在这里进行过义诊服务,比如美国国立卫生研究院(NIH)主任弗朗西斯·柯林斯(Francis Collins)等。
附:祁鸣教授简介
浙江大学985计划特聘教授、博士生导师,美国罗彻斯特大学病理与检验系兼职教授。
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