陆地棉基因组图谱绘制完成

本报讯 (记者黄哲雯)中国农科院棉花研究所牵头主持,联合北京大学、深圳华大基因、美国农业部南方平原研究中心等单位,日前共同完成了世界上广泛栽培的陆地棉的全基因组测序及图谱绘制,在基因组学研究领域取得突破性成果。

异源四倍体物种陆地棉是世界上最重要的纤维作物和模式多倍体作物。棉属包括46个二倍体和5个四倍体棉种,所有的二倍体棉种均来自同一祖先,经演化形成了A、B、C、D、E、F、G和K基因组,四倍体棉种的基因组类型为AD。目前认为,AD基因组是由A基因组祖先与D基因组祖先杂交后染色体加倍而形成的,其中就包括陆地棉。高质量组装异源多倍体植物基因组是一个艰难的任务,因为这种基因组比较大,包含大量的重复序列和高度同源的亚基因组。

在该研究中,科研人员对陆地棉遗传标准系—TM-1进行了全基因组测序和组装,最终获得了26条染色体;通过基因组注释,得到了76943个蛋白编码基因;利用比较基因组学方法,首次从全基因组水平揭示了四倍体棉花是由A基因组的祖先和D基因组的祖先通过染色体融合而形成,并初步揭示了四倍体棉花基因组的进化规律。

据该项目的主要负责人李付广研究员介绍,我国是世界上最大的纺织品生产国和消费国,在国民经济中具有十分重要的地位。四倍体棉花-陆地棉(AD组)基因组图谱绘制完成,将加快棉花新品种的选育,对我国棉花产业的可持续发展具有重要意义。

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