测序技术能否应用于品种鉴定中？

第一，全基因组测序并不适合直接用于品种鉴定中。品种鉴定主要是寻找样品间差异的过程，在全基因组水平上，品种间甚至物种间绝大部分碱基序列是相同的，如人类与灵长类全基因组序列98%以上核苷酸相同，DNA序列中无差异的部分对于品种区分没有实际意义。

第二，基因组测序，仅针对某个基因组如叶绿体基因组、线粒体基因组以及外显子区测序等方法也不适合用于品种鉴定中。

第三，基于第二代测序技术进行SNP基因分型方法，或者利用Nimblegen序列捕获芯片技术，设计探针捕获到目的SNP区域片段，在基于测序技术检测基因型。随着测序技术的发展和成本的降低，机遇测序技术检测SNP的方法具有一定发展潜力。

DNA指纹鉴定技术的发展历程？

随着现代生物技术发展，品种鉴定技术从形态鉴定进入到DNA指纹技术水平。品种指纹鉴定技术发展经历了3个重要阶段：20世纪90年代的第一代标记技术RELP（限制性片段长度多态性）和PARD（随机扩增多态性），21世纪初兴起的第二代标记技术SSR（简单重复序列），近几年启动研究的第三代标记技术SNP（单核苷酸多态）。其中，SSR和SNP被UPOV的BMT分子测试指南推荐作为品种鉴定和数据库构建的优选标记。

采用不同器官组织提取DNA对品种鉴定有无影响？

DNA指纹技术通过鉴别不同品种间遗传物质DNA的碱基组分、排列顺序不同，从而区分不同品种。对于一个玉米品种而言，从其种子、幼苗、叶片、苞叶中提取的DNA代表了该品种的基因组序列特征，对DNA指纹鉴定的结果准确性不会产生任何影响；但从杂交种种子果皮上提取的DNA和从杂交制种天母本植株所结的果穗籽粒提取的DNA并不能代表该品种的基因组序列特征，会严重影响该品种的DNA指纹鉴定结果准确性。

品种分子监测与转基因检测有何异同？

相同之处是应用的技术手段基本相同。

不同之处，一是品种真实性及纯度鉴定的分子检测是对品种的整体遗传背景的监测，具体选用的引物位点因所鉴定的物种不同而不同；转基因检测是对目的基因的监测，具体引物位点的选择因所鉴定的基因而不同，与物种无关。二是两种检测项目在实验污染控制方面是不同的，造成污染的原因也不同。种子真实性和纯度检测污染主要出现在样品准备阶段，环境中的外源核酸一般不会对其检测结果产生影响；而转基因检测主要污染出现在PCR扩增阶段，环境中的外源核算容易导致检测结果出现假阳性。

——摘编自中国农业科学技术出版社《玉米品种DNA指纹鉴定技术100问》 （农民日报）

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