单细胞基因组与转录组平行测序


4月27日《Nature Methods》刊登了一项新的测序方法。该技术被称为G&T-seq （Genome and Transcriptome Sequencing）,能够实现大规模的DNA和RNA平行测序，同时展现单个细胞的基因组序列和基因活性。

在单个细胞中同时测序基因组和转录组，有助于更深入的理解正常组织和疾病组织之间的遗传学差异，为人们提供正常发育和疾病发展的新线索。研究人员可以通过G&T-seq更好的理解肿瘤中的癌细胞多样性。

G&T-seq: parallel sequencing of single-cell genomes and transcriptomes.Macaulay IC,et al.Nat Methods. 2015 Apr 27.

相关链接： http://www.nature.com/nmeth/journal/vaop/ncurrent/full/nmeth.3370.html

3月15日《Nucleic Acids Reserch》刊登了新加坡A*STAR和清华大学的研究人员合作开发的一种灵敏的通用文库构建法。该方法被称为TELP (Tailing, Extension, Ligation, and PCR)，可以减少样本损失，实现高灵敏度的NGS文库制备。

尽管在起始材料非常少的时候出现了一些背景信号，但在片段选择之后这并不会对文库质量造成太大影响。用途广泛是TELP的一大优势。该方法还可以直接用于多种应用，比如小规模ChIP-seq、RNA-seq和methylC-seq。

TELP,a sensitive and versatile library construction method for next-generation sequencing.Peng X, ,et al.Nucleic Acids Res. 2015 Mar 31.

相关链接： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4381050/

本文来源于：测序中国

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