全基因组测序技术追溯百年冰激凌工厂中的李斯特菌污染

近日，位于美国德克萨斯州的Blue Bell冰激淋工厂，因其生产的冷冻产品被发现含有李斯特菌污染，而召回了所有产品。截至目前，已有10人因李斯特菌感染，其中3人死亡。

卫生官员对该次李斯特菌感染进行了追踪检测，确定疾病爆发的原因。此次检测主要采用全基因组测序的技术对细菌进行基因分析。全基因组测序技术此前主要用来进行医学研究，这是第一次用来进行李斯特菌感染暴发的追踪。

Blue Bell冰激凌首次出现李斯特菌污染的迹象是在1月份。南卡罗来纳州健康和环境控制部门曾随机抽查了冰激凌样本。南卡罗来纳州政府官员发现两款Blue Bell冰激凌被大量李斯特菌污染。南卡罗来纳州政府通知了FDA，此后引发了一系列连锁反应。

根据南卡罗来纳州的情况，德克萨斯州的国家卫生服务部门对Blue Bell公司位于德克萨斯的工厂进行抽查，同样检测到李斯特菌超标。这些样本中的李斯特菌与李斯特菌感染病人体内的病菌相匹配。堪萨斯州的卫生官员在进一步对Blue Bell产品检测后，发现在俄克拉荷马州也出现了李斯特菌污染的冰激凌。此后FDA和Blue Bell对该公司的产品进行了大规模检测，最终该公司的所有工厂车间全部停工，并召回全部产品。

沿着这一线索，联邦官员对五年前的10例病人的样本进行检测，发现这些病人感染的李斯特菌与这次的暴发有联系。美国疾病预防控制中心（CDC）的Robert Tauxe博士表示，研究人员需要培养病人的粪便或血液，从中提取DNA进行全基因组测序，再与国家食源性疾病样本数据库里的样本进行匹配。所幸，国家实验室保存有样品，能够用于疫情的确认。

现在，FDA已接管此次调查事件，到目前为止还没有任何新消息。李斯特菌具有很强的环境适应能力，即使在冷冻下也可以生长。它主要以食物为传染媒介，是最致命的食源性病原体之一。很多国家都已经采取措施来控制食品中的李斯特菌，并制定了相应的标准。

Blue Bell公司表示，将对其生产车间进行全面清理，加强员工训练，并且每天对更多的车间设备进行微生物检测。这家有着108年历史的公司还表示，在配送前将对该公司所生产的所有产品进行检验。

这次追踪，使得卫生官员有信心能够更快更准确的对未来疾病暴发进行追踪。

Robert Tauxe博士说：“全基因组测序赋予我们新的能力来调查棘手案件。”

本文来源于：测序中国

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