PNAS:mRNA转录能驱动T细胞可变剪接

摘要 : 宾夕法尼亚大学和加州大学的研究团队深入分析了T细胞的可变剪切及其调控机制,揭示了在人类免疫系统发育过程中改变基因表达的一系列事件

宾夕法尼亚大学和加州大学的研究团队深入分析了T细胞的可变剪切及其调控机制,揭示了在人类免疫系统发育过程中改变基因表达的一系列事件,发表在近日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。解析可变剪切的机制和模式,有助于全面理解细胞在不同条件下对基因组的解读,”Lynch说。可变剪切是基因调控的一个关键机制,能对T细胞的发育和抗原信号进行应答。不过人们还不清楚这种调控的具体规模和机制。

T细胞在对抗感染或者发育成熟的时候,需要借助多种新蛋白才能做出必要的改变。细胞一般通过两种途径做到这一点:启动新基因生产新蛋白,或者改变mRNA剪切模式获得蛋白异构体。这两种机制既能独立起作用,也能共同起作用。研究人员发现,T细胞在应答入侵抗原或者肿瘤时,RNA结合蛋白CELF2的表达水平会提高。在体外培养的T细胞中,CELF2增多使mRNA剪切发生了广泛的改变。在胸腺中,CELF2增多也和T细胞发育时的剪切变化有关。

研究人员通过二代测序列出了T细胞五千个外显子的剪切模式,分析了T细胞激活时发生的剪切改变。可变剪切会使蛋白质发生重要的生理改变,比如蛋白质活性、作用位点以及蛋白质互作。“我们这是首次列出T细胞发育过程中的剪切改变,”Lynch说。“研究表明,在T细胞激活和T细胞发育过程中,CELF2表达水平提高引起了大量的剪切改变。

这些结果为人们提供了宝贵的线索,有助于进一步理解T细胞的剪切调控,以及CELF2在其中起到的重要生物学作用。”

原文链接:

Induced transcription and stability of CELF2 mRNA drives widespread alternative splicing during T-cell signaling. Proceedings of the National Academy of sciences

原文摘要:

Alternative splicing is a key mechanism for gene regulation that is regulated in response to developmental and antigen signaling in T cells. However, the extent and mechanisms of regulated splicing, particularly during T-cell development, have not been well characterized. Here we demonstrate that expression of the RNA binding protein CELF2 (CUGBP, Elav-like family member 2) is increased in response to T-cell signaling through the combined regulation of transcription and mRNA stability. This increase in CELF2 expression drives widespread changes in mRNA splicing in cultured T cells and correlates with changes in mRNA splicing during T-cell development. These results provide unprecedented insight into the regulation of splicing during thymic development, and reveal an important biologic role of CELF2 in human T cells.

作者:Michael J. Mallorya

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