中国科学家Nature子刊再发GWAS研究新成果
导读:
来自南京医科大学、清华大学、宁夏医科大学总医院等十多家机构的研究人员,通过全基因组关联研究(GWAS)鉴别出了非综合征性唇裂或唇腭裂(Nonsyndromic cleft lip with or without a cleft palate,NSCL/P)的一个新易感位点。这一研究成果发表在3月16日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。
南京医科大学的沈洪兵(Hongbing Shen)教授、王林(Lin Wang)教授以及宁夏医科大学总医院的杨银学(Yinxue Yang)教授是这篇论文的共同通讯作者。
先天性唇腭裂是人类最常见的先天性畸形之一,一般在危险因素致畸的作用下,发生在胚胎发育4~12周。唇腭裂患者不仅存在外形上的缺陷,其饮食、语言等功能也伴有不同程度的障碍,常常造成性格缺陷,影响正常的社会交往,降低生活质量,又因治疗程序复杂、周期漫长、花费大、给家庭和社会带来沉重负担,严重影响了出生人口素质,因此寻找该病的病因,进而找到有效地预防手段显得非常重要。
从遗传学上唇腭裂分为综合征性唇裂或唇腭裂、综合征性腭裂、非综合征性唇裂或唇腭裂(NSCL/P)和非综合征性腭裂(NSCP)。综合性唇腭裂一般因为染色体异常或单基因发生突变所致,病因比较明确。而非综合性唇腭裂的发病原因至今医学界仍无定论。NSCL/P的发病率为0.1-0.2%,其发病机制不明,病因复杂具有明显遗传异质性。研究结果发现,NSCL/P的发生是环境、遗传因素以及二者相互作用的结果,其中遗传因素起重要作用。
GWAS是一种对全基因组范围内的常见遗传变异(单核苷酸多态性和拷贝数)基因总体关联分析的方法,在全基因组范围内进行整体研究,能够一次性对疾病进行轮廓性概览,适用于复杂疾病的研究。在全基因组层面上,开展多中心、大样本、反复验证的基因与疾病的关联研究,有可能全面揭示出疾病发生、发展与治疗相关的遗传基因。
在这篇文章中研究人员报告称,他们在进行了第一轮基于病例对照的GWAS研究后又进行了两轮的重复验证。他们利用来自中国的6个独立组群阐明了在中国人群中NSCL/P的遗传结构。通过这样的综合分析,研究人员鉴别出了一个定位在16p13.3与NSCL/P相关的新位点:位于CREBBP和ADCY9之间的rs8049367。他们还证实以往报道过的定位于1q32.2、10q25.3、17p13.1及20q12的位点也与中国人群NSCL/P形成有关。
研究结果进一步地提供了证据证实,定位在1q32.2的rs2235371相关单体型相比以往在中国人群中发现的因果变异rs642961发挥了更重要的作用。这些研究发现为我们提供了有关NSCL/P遗传基础和机制的一些重要信息。
本文来源于:生物通
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