甘蓝BoKIN1基因的ploy(A)位点的预测及其频率分析

多聚腺苷酸化(polyadenylation)是真核生物中一种重要的pre-mRNA加工机制，是mRNA成熟的一个必经过程。为了解甘蓝BoKIN1基因的多聚腺苷酸化加工情况，本研究从甘蓝全基因组数据库中下载得到BoKIN1基因序列，并利用生物信息学手段分析了BoKIN1的基因结构和基因表达。研究结果显示：BoKIN1基因在花器官中表达最高；然后基于EST文库发现了3个ploy(A)位点，并计算了这些ploy(A)位点在pre-mRNA加工过程中被选择的大致频率情况，显示BoKIN1基因在pre-mRNA加工过程中至少有6个 ploy(A)位点可供选择加尾，其中AP4位点被选择加尾的频率最高，其次是AP5位点。因此选择AP4位点加尾后形成的mRNA是转录后加工的主要产物。通过本研究我们确定了甘蓝类BoKIN1基因6个选择性加尾位点及其3’UTR的主要产物和次要产物，对于未来进一步利用这些3’UTR奠定基础。