《Genome Biology》发表我校基因组与生物技术研究中心研究成果

近日,我校基因组与生物技术研究中心(下文简称:基因组中心)发表了题为“ALLMAPS: robust scaffold ordering based on multiple maps”的研究论文,研究为提高基因组组装的准确性和完整性提供了理论基础和应用软件工具。该项研究成果于2015年1月13日在国际著名学术杂志《Genome Biology》(IF=10.5)在线发表,福建农林大学为文章的第一作者单位和第一通讯作者单位。基因组中心唐海宝教授为文章第一作者兼通迅作者,中心研究生苗晨勇、张积森教授、明瑞光教授参与此项工作。

随着基因组测序技术的高速发展,研究人员可以花费较低的代价得到大量序列信息,而如何准确定位这些序列在染色体上的位置是当前基因组研究的难点。多种图谱信息可以提供相互独立的染色体定位信息,包括遗传图谱、物理图谱、光学图谱、物种间同线性关系等,然而不同图谱各自存在较高的错误率。基因组中心提出了一种称为ALLMAPS的方法,可以自动整合多张图谱,从而提高基因组组装的准确性和完整性。

据悉,基因组中心于2013年8月份开始运行,先后在《Current Opinion in Plant Biology》、《The Plant Journal》、《Molecular Plant》、《The Journal of Experimental Botany》等高水平研究杂志发表文章15篇。

文章相关链接:http://genomebiology.com/2015/16/1/3/abstract

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