版纳植物园生物信息数据分析工作站投入运行

为进一步完善版纳植物园二代高通量测序平台，满足大量测序数据的处理分析，版纳植物园公共技术服务中心通过2014年“修购专项”购置了一套适合版纳植物园现阶段的生物信息数据分析工作站（小型高性能计算机群）。它不仅能为生态学相关数学模型的建立提供操作平台，而且对生物信息学相关数据的比对、拼接和分析等提供硬件支持，填补我园信息化评估超算项的空白。

2014年12月1日-1月12日，公共技术服务中心的工作人员协同仪器工程师对该工作站进行开箱、安装、调试、培训、验收和试运行。

此次安装的数据分析工作站为惠普Proliant系列高性能计算机集群系统，总体峰值计算能力5.4万亿次，实测linpack效率达到97%；计算部分由8台HP刀片服务器（配置2颗E5-2670 10核处理器）和2台HP大内存服务器（配置1.514TB内存和4颗intel xeon E7-4870 15核处理器）组成；管理部分为5台机架式服务器；计算网采用56Gbps infiniband高速互连，并通过3个IO节点连接到100T的并行存储；管理网络采用千兆以太网。在网络安全方面，架设了硬件防火墙，外网通过VPN方式访问。存储部分采用HP MSA 2040双控制器模块化存储阵列读写存储。为保证数据存储安全，采用了RAID5磁盘阵列技术、热备份和冷备份三保险。系统除了安装部署ParaPlus机群管理软件、Redhat Linux6.5企业版操作系统、作业管理系统LSF之外，也安装调试了生物相关串行、并行数据分析应用软件，如bowtie（序列比对），bwa（序列比对），clustalw-mpi（多序列比对），crop（聚类分析），mpiblast（并行比对），R（支持包），SOAPdenovo2（组装），stacks（重测序），Trinity（转录组）和velvet（组装）等。

在安装调试期间，仪器工程师对仪器主要管理人员进行仪器操作和维护培训，对园内课题组相关研究人员进行软件操作培训。

仪器安装调试完成之后，版纳园修购工作组先后组织2次验收：（1）修购工作组组织园内外的技术专家（昆明植物所、昆明动物所）11人组成了专家组，召开设备验收小组第1次验收会议，对“生物信息数据分析工作站采购项目（计算部分）”进行技术验收；科技外事处在现场对整套设备进行软硬件设备查验，审阅核实了有关材料，测试了系统性能指标，经提问、答疑和讨论后，通过了计算部分的验收；（2）精密空调安装完成，验收小组进行第2次验收，对采购项目进行整体验收。2次验收均顺利通过。

目前，该工作站已进入面向全园进行仪器运行的试运行阶段，有5个课题组参与测试。满足了我园大量测序数据的处理分析。该工作站的安装和运行将为我园未来建设集数据服务积累经验。

生物信息数据分析工作站

仪器验收系统性能指标测试

工程师对仪器管理人员问题解答

工程师对仪器管理人员及用户进行培训