羊草全基因组测序计划全面启动

近日，由中国农业科学院草原研究所牵头，联合中国农业科学院深圳农业基因组研究所等单位共同合作的羊草全基因组测序计划已全面启动。该计划完成后，将对我国极为丰富的羊草资源的新品种选育、人工草地建植、天然草原生产力提高以及产业开发等工作带来重要推动作用。
羊草（Leymus chinensis(Trin.) Tzvel.）是禾本科赖草属多年生根茎型草本植物，广幅旱生草原的建群种、盐生草甸的优势种，是一种重要的优良牧草。羊草主要分布于欧亚大陆温带草原地区，在我国境内的分布约占总分布面积的50%。羊草作为温带草原和草甸群落的关键建群种，在维持中国北方草原生态系统稳定、生物多样性、草地生产力等方面扮演重要角色。同时，作为优质牧草，在推动我国草地畜牧业健康发展上起着重要作用。

据此项测序计划的主要推动者之一、中国农业科学院草原研究所侯向阳所长介绍，羊草的基因组来源、系统发育关系与地位、物种起源至今缺乏有力证据；与草原退化相关的羊草结实率低、发芽率低、繁殖率低等“三低”问题、生态可塑性、放牧退化等问题长期困扰其合理开发与利用，而从全基因组序列中提取的生物学信息可为解决以上诸多问题提供有力证据。同时，通过羊草全基因组测序后，其蕴含的海量生态功能信息将极大地促进牧草基因组和草原生态基因组学的发展。
中国农业科学院深圳农业基因组研究所黄三文研究员介绍，羊草是高度杂合及多倍化的草本植物，我们将以新一代测序技术为基础设计羊草全基因组测序方案，完成其全基因组测序、组装和注释等，并以此为核心开展一系列基因组水平上的探索和研究。
中国农业科学院副院长吴孔明院士指出，羊草全基因测序开辟了一条从微观领域研究大草原的新思路，对于解决草原退化与草地畜牧业等问题具有特殊的意义。同时他指出赖草属是小麦族多年生植物中用于小麦远缘杂交育种最有利用价值的一个属，从赖草属中向小麦转移耐盐、抗病基因是小麦育种家的主要目的。羊草是小麦及其他禾本科牧草的近缘种，基因组存在广泛的共线性或同线性及微共线性，在进化过程中呈现高度保守性；通过全基因组序列分析的得到一些优良性状基因将成为麦类作物和牧草遗传改良的重要基因资源。
该计划将填补草原植物基因组研究的空白，有力推动草原生态系统、生物多样性、草地改良、草地畜牧业等的健康发展。同时，该计划的完成还将为世界牧草基因组、生态基因组及复杂基因组等研究提供全新的起点和平台。（武自念）