丽鱼科鱼基因组适应性辐射的标志(Nature)

在非洲大裂谷的湖泊和河流中发现的2000种左右的丽鱼科鱼，是适应性辐射的经典例子。这一大规模国际合作项目，对5个截然不同世系的非洲丽鱼科鱼的基因组和转录组进行了测序和分析。所获数据显示，与其他鱼种相比，它们的基因复制过多。存在大量非编码要素分化(element divergence)、加速的编码序列演变、直系同源基因对中与可转座要素插入相关的表达分化(expression divergence)以及由新颖miRNA进行的调控。对来自6个密切相关的维多利亚湖鱼种的60个个体所做的测序数据，指向丽鱼科鱼与对编码变体和调控变体的全基因组分化选择相关的迅速物种形成，同时也说明古代纯化选择(purifying selection)放松的时期使得既有变异(standing variation)能够累积，后者在促进分化中可能起重要作用。

Article p.375

doi: 10.1038/nature13726 | 全文 | PDF

News & Views p.318

doi: 10.1038/nature13742 | 全文 | PDF

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