RNAcentral：非编码RNA序列的国际数据库

自20世纪50年代以来，科学家曾经把RNA看作是一种中间分子，提供稳定DNA和蛋白质之间的联系。然而，在过去的十年里，很明显RNA在生物体中发挥着更广泛的作用。研究人员已经发现了很多不同类型的RNA，但是直到现在，这些数据还没有被放置在一个地方。

在RNAcentral之前，寻找由特定基因组编码的RNA，需要从几个独立的资源提取信息，例如从miRBase提取micrornA，从HAVANA提取lncRNA信息。

EMBL-EBI蛋白质序列资源带头人Alex Bateman解释说：“目前已经发表了很多的非编码rna数据，但是每种子类型都是独立保存的。这是第一次，我们有一个中心地带，在这里你可以找到所有：piRNAs、核糖体RNA等等一切。大量信息通常被锁定在补充材料中，或者只被称为非标准的基因名称。RNAcentral，是向产生像蛋白质序列那样容易访问的RNA序列，迈出的一大步。”

RNAcentral 1.0提供十种不同专家数据库的数据访问，并提供稳定的登录号，可以始终用于文献、其他分子数据库和搜索引擎中。RNAcentral网站的特点是分面检索，这可让用户根据来源、物种和分子功能，搜索不同的RNA序列。进一步的专家数据库预计将在未来发布。

RNAcentral联盟起源于Wellcome genome Campus在2010年举办的一次研讨会，当时RNA团体的成员聚集在一起，讨论集中访问RNA数据方面的不足。

曼彻斯特大学的Sam Griffiths-Jones解释说：“看到这个项目取得的成果，真的很让人欣慰。非编码RNA序列和功能性信息的增长是惊人的，并且没有显示出放缓的迹象，对这些数据通用资源的更大需求前所未有。RNAcentral联盟成员合作产生的这个资源，代表RNA领域的一个巨大进步。”

由于来自英国生物技术和生命科学研究委员会(BBSRC)的资助支持，世界各地的合作机构才能走到一起，就一个共同的问题，形成一种切实可行的解决方案。

BBSRC首席执行官Jackie Hunter教授说：“非编码RNA的基础研究有许多潜在的应用，包括疾病诊断、新疗法和生物技术。现在，由于下一代测序，可利用的数据越来越多，迫切需要信息学工具来破解它们。RNAcentral是一种至关重要的资源，将把信息整合和集成为统一数据，并提高世界各地研究人员对数据的发现和利用。”

这一资源利用EMBL-EBI的基础设施，尤其是欧洲核苷酸档案(ENA)提供的数据提交和交叉参考服务。它利用来自国际核苷酸序列数据库合作(INSDC)的全球同步数据。

RNAcentral的未来版本将包括关于RNA结构、修饰、分子间相互作用和功能的附加数据类型和信息。相关文章发表于近期的《Nucleic Acids Research》杂上，详细地描述了RNAcentral工具及特点。

论文标题：RNAcentral: an international database of ncRNA sequences

作者：生物帮