数字基因表达谱测序(gene expression seq)

摘要 : 数字基因表达谱(DGE)测序指直接对某一物种或特定细胞在特定功能状态下产生的mRNA进行高通量测序，研究基因的表达差异情况，已被广泛应用于基础科学研究、疾病机理、生物标记和药物研发等领域。一次测序可产生5M以上的mRNA标签，可准确检测低丰度基因转录本，并同时检测反义链转录本。与芯片技术相比无交叉杂交和背景噪音信号干扰，被测得的次数即是对应基因的表达值，用数字信号代替了模拟信号，增加了数据的可信度。

技术简介

数字基因表达谱(DGE)测序指直接对某一物种或特定细胞在特定功能状态下产生的mRNA进行高通量测序，研究基因的表达差异情况，已被广泛应用于基础科学研究、疾病机理、生物标记和药物研发等领域。一次测序可产生5M以上的mRNA标签，可准确检测低丰度基因转录本，并同时检测反义链转录本。与芯片技术相比无交叉杂交和背景噪音信号干扰，被测得的次数即是对应基因的表达值，用数字信号代替了模拟信号，增加了数据的可信度。

锐博生物推出表达谱测序，该技术结合了转录组测序建库的实验方法与数字基因表达谱(Digital Gene expression Tag Profiling, DGE)的信息分析手段，可广泛应用于生理调控、农业性状、生物标记、环境改造、疾病机制和药物筛选等领域。

技术特点

数字化信号：不需要基于预知序列信息的探针;测序直接获得序列，无背景噪音，无交叉杂交;可鉴别序列间单个碱基的差异

定量更准确：不仅可定性检测差异表达水平，还可定量检测基因的表达丰度;使用FPKM方法计算基因表达水平

良好的重复性：深度测序保证了抽样随机性，重复性非常好

任意物种的检测：适用于所有有参考基因组的真核物种

高通量：一次测序得到千万条级别以上的序列

服务流程

生物信息学分析内容

标准信息分析

1. 去除接头序列及低质量reads的处理

2. 测序质量评估

3. 参考基因组比对

4. 全基因组reads分布图谱

5. 基因表达分析

6. 差异基因KEGG生物通路富集分析

7. 差异基因GO功能富集分析

作者：砂之时光

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