多国合作完成花生二倍体野生种全基因组测序

国际花生基因组计划首次完成两个二倍体野生种全基因组测序并公布序列

2014年4月2日,国际花生基因组计划(International Peanut Genome Initiative,IPGI)在美国弗吉尼亚州亚历山大市(Alexandria, Virginia)发布了首次成功完成花生基因组测序的新闻。花生基因组测序的完成和序列的公布将为全球研究人员和植物育种家培育更高产、适应性更广的花生新品种提供支撑。

IPGI发布的消息称,多国合作开展的花生全基因组测序取得了重大进展,分别代表花生属A基因组和B基因组的两个二倍体野生种的全基因组测序已经顺利完成,获得的两个二倍体野生种的序列覆盖了花生基因组96%的基因,这一进展对于花生的基础和应用研究具有里程碑意义。中国是国际花生基因组测序计划的重要合作伙伴,此次参与基因组测序的中方合作单位包括河南省农业科学院经济作物研究所、中国农业科学院油料作物研究所、山东省农业科学院生物技术研究中心,华大基因(BGI)参与了测序工作。玛氏(MARS Inc.)集团公司、美国花生基金会(The Peanut Foundation)及中方合作单位等提供了资金支持。有关二倍体野生种的基因组序列组装件和补充资料可从网页http://peanutbase.org/files/genomes/中查询。

花生是世界上重要的油料和经济作物,分布在全球100多个国家。其中,中国是世界上最大的花生生产、消费和出口国,总产量、消费量和出口量均占全球的40%以上,花生在发展农业生产、增加植物油和蛋白质供给中的作用不断上升。

河南省农业科学院副院长、花生育种专家张新友说,花生栽培种(Arachis hypogaea L.)是异源四倍体(AABB),而二倍体野生种A. duranensis和A. ipaensis被认为是栽培花生A基因组和B基因组的祖先供体,由于栽培种花生基因组庞大(2.8 GB)而复杂,基因组测序和分析非常困难,严重阻碍了基因组手段在花生改良上的应用,因此二倍体野生种测序的完成对下一步四倍体栽培种的测序、分析、拼接具有重要参考价值。

山东省农业科学院生物技术研究中心副主任、分子生物学专家王兴军说,花生基因组测序工作已经进行了多年,由中国华大基因和加州大学戴维斯分校引领的两个花生二倍体野生种 (A和B基因组) 测序工作的完成将有助于深刻阐明花生的起源与进化、系统解析重要性状形成的分子基础、高效发掘控制重要农艺性状的功能基因。

中国农业科学院油料作物研究所副所长、花生植物病理专家廖伯寿说,野生种具有丰富的抗病、抗逆等栽培种中所缺乏的优异基因资源,两个野生种全基因组测序的完成必将极大地推动花生分子设计与聚合育种的开展,对于增加花生产量、提高生产效益、保障食品安全、促进产业可持续发展等方面具有重要的理论价值和应用前景。

张新友、廖伯寿和王兴军是国际花生基因组计划执行委员会成员。

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