华大科技杂合基因组组装技术获重大突破

中国经济网,2013-03-15,作者：杨阳腾 李小芳

中国经济网记者今日从华大基因研究院获悉，3月4日，深圳华大基因科技服务有限公司(简称“华大科技”)推出杂合基因组解决方案—Ultra-Deep De novo，可以帮助科研人员更加高效地解决杂合基因组组装难题。目前，科研人员采用此方案成功完成了多个杂合基因组的图谱绘制工作，这标志着继牡蛎、小菜蛾、梨基因组后，华大基因在杂合基因组组装技术上又取得了新的重大突破。

全基因组图谱是现代生物学研究的重要基石，一个物种基因组序列图谱的完成，意味着这个物种学科和产业的新开端。基因组杂合的情况广泛存在于具有重要经济或科研价值的物种中，传统的杂合基因组图谱绘制方案成本高、周期长，严重制约了这些物种基因组的解读。

据了解，Ultra-Deep de novo方案基于新一代高通量测序技术，通过超高深度测序(>200X)，采用最新版SOAPdenovo2软件进行组装，结合杂合序列识别算法，可以完整地保留并区分杂合区域的信息，从而大大提升了组装效果及基因组序列图谱质量。目前，华大科技应用该方案已完成了包括林木、昆虫、海洋等多个领域杂合基因组图谱绘制工作。

华大基因于2010年1月发起“千种动植物基因组计划”，截至2013年2月，已经启动了570多个物种基因组研究，但还有浩瀚数量的物种基因组因杂合而无法解读。Ultra-Deep de novo方案将极大推动杂合基因组研究的进展，为快速获得这些物种的高质量基因组图谱提供了强有力的保障。

华大科技高级副总裁王军一博士指出：“Ultra-Deep de novo是基因组组装技术新的里程碑，我们期待与国内外科学家开展广泛的合作，进行更多物种的基因组研究，为农业发展和人类健康做出更多的贡献。”