上海交大课题组双芯片系统构建高通量转基因作物检测平台

美国化学学会旗下化学类A区期刊Analytical Chemistry近日发表了上海交通大学系统生物医学研究院陶生策课题组和生命科学技术学院张大兵课题组利用高通量多重PCR芯片结合寡核苷酸探针芯片实现转基因作物高通量检测的最新成果。该成果同时成为美国化学会新闻网站CHEMICAL & ENGINEERING NEWS的亮点报道之一。据悉，课题组已将此成果申请专利。

截止2012年底，约1.7亿公顷300多种转基因作物在全球28个国家商业化种植。如何从复杂样本中对众多的转基因作物进行快速有效的检测和标识，在技术上是一个重大挑战。为此，人们发展了众多不同类型的检测技术，但其中绝大多数只能检测很少一部分转基因靶标。

迄今为止，仍没有任何一种技术或方法能在一次反应中实现对所有转基因作物的全局性检测。在课题组前期发展的一套基于亲疏水微孔芯片的多重pcr技术(Li,et al.,Lab Chip,2011,11,3609)的基础上，课题组实现了一张微芯片上同时扩增上百种转基因靶序列，靶序列扩增产物由另一张包含所有识别靶序列的寡核苷酸探针DNA芯片解读出来。本技术检测的转基因靶序列远多于已有研究和报道，且系统具有极好的扩展性，检测通量可根据需要进一步提高。

大量实际样本检测结果显示本方法具有高特异性和灵敏度，检测准确率达到99%以上。同时，建立的双芯片系统还可以用来监测未知的转基因产品成分。目前该课题组正进一步对双芯片系统进行系统性简化，相信在转基因检测领域能很快发挥实际作用。该技术具有较强的通用性，可用于其它高通量核酸检测，如传染病和遗传病的高通量筛查等。

该研究得到国家科技部项目和国家转基因生物新品种培育重大专项基金的支持。成果文章的共同第一作者为博士生邵宁和硕士生蒋诗萌，通讯作者为陶生策研究员和生命学院杨立桃副教授。

原文链接：MACRO: A Combined Microchip-PCR and Microarray System for High-Throughput Monitoring of Genetically Modified Organisms

标签: 转基因作物 上海交大 双芯片系统

作者：上海交大