西藏自治区农牧科学院联合华大科技成功绘制青稞基因组图谱 为解读高原粮食作物适应性机制和促进作物改良奠定基础
2014年3月2日,西藏自治区农牧科学院与深圳华大基因科技服务有限公司(以下简称“华大科技”)联合宣布完成青稞基因组图谱的绘制。该项科研成果将为深入揭示西藏青稞这一裸大麦品系的起源、驯化及栽培选育过程等奠定了坚实的遗传学基础。
青稞,在西藏语中称为Ne,在分类学上是一种裸大麦。青稞在青藏高原经过3500~4000年的驯化栽培,已经适应极端高原气候。青稞是西藏人民的主食,种植面积占西藏耕地的70%。西藏一直是青稞的驯化和多样化品种栽培中心。考虑到青稞的重要性以及西藏自治区农牧科学院拥有丰富的种质资源,西藏自治区农牧科学院携手华大科技于2012年启动了青稞基因组研究合作项目。
研究人员采用高测序深度及长读长配合的测序方法,对西藏的地方青稞品种Lasa Goumang 进行了全基因组测序及图谱绘制。结果显示,青稞基因组大小约为4.5Gbp,组装的基因组大小3.89Gbp,共包含39,197个蛋白编码基因,重复序列含量高达80%以上。同时为了研究青稞的高原抗旱适应性,研究人员对不同干旱条件下的青稞叶子组织进行了转录组测序,以分析干旱耐受条件下的基因表达调控机理。研究人员还将青稞与小麦(A、D)、水稻、高粱、玉米等单子叶植物的基因组做了比较分析,研究进化机制,从比较基因组方向进一步解析青稞的生物学特质,为后续优良栽培品种选育和改良奠定基础。
华大科技执行总裁李英睿指出:“我们非常高兴同西藏自治区农牧科学院联合绘制青稞基因组图谱。华大科技一直致力于用基因组技术造福人类,我们已联合国内外研究单位完成水稻、玉米、大豆、马铃薯、小麦等重要农业物种的基因组图谱解析。今后华大科技将再接再厉,更好地利用基因组技术为中华民族粮食短缺及食品安全提供支持和技术保障。”
西藏自治区农牧科学院院长尼玛扎西指出:“青稞基因组图谱成功完成解析离不开华大科技的鼎力支持,我们相信该图谱无论对青稞种质资源科学研究还是青稞品种改良,都是坚实的遗传学基础。”
关于华大科技
深圳华大基因科技服务有限公司(简称华大科技)成立于2012年4月,是全球最大的基因组学研究机构——华大基因旗下的子公司,秉承“科技合作与服务”的产业理念,致力于成为全球科研工作者的首选科技合作伙伴。依托丰富的科研经验、先进的技术平台以及卓越的人才队伍,华大科技为投身于生物、农业、医药等生命科学领域的研究人员提供涵盖常规分子生物学、高通量测序及分析、质谱分析、云平台、高端咨询等一站式、全方位的生物技术服务和系统解决方案。华大科技总部位于中国深圳,共有1500多名员工,在欧洲、美洲、亚太地区均设立了业务中心、分部及办事处,服务网络已经遍布全球。目前,华大科技在全球已拥有7000多家合作单位、20000多位合作伙伴,为一系列大型基因组科研计划和国际合作项目提供了杰出的科研服务,并依托华大基因,主导或参与发表了600余篇科研论文,其中CNNS文章超过100篇。
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